XLOC_044905 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044905
Unique NameXLOC_044905
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_76:117680..182236-

Legend: gene
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>XLOC_044905 ID=XLOC_044905|Name=XLOC_044905|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=64557bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_76:117680..182236- (Clytia hemisphaerica)
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CCGGGTATTAGACATTCTAATGCTATTAAAAATGCAAAGATGACTGATTG CCCTTAGACTAGAATCTTTAAGGGGTATCCTAATTTACCCGCTTGCTTTT ACACGTTTTTATAAGAACAAAATAGGTTTCGATGTCCAAAGTAGAAAGAA CAAGTTAAGAACATTTTAAGGGTTTGCCGACTCAAAAACATCCCATTTCT TAGGTGAATGGAAAAAAATCCTCACAAAATAATGAGAATAAGAACATGCT AAGAACATTTTTAAAGATTCAAAAAGTTTTGAACATCCGAAGACTTGAAA GATTTTGGATTCTCTTATAGAAAAAAATGTATCAGAGGCTCATGCTCATT ATCATGTTTAATCATACCTCATCGGCCGGAATTTTCAAACAGGGCCTTTA ATCTGCCACCGCTCAATTTTGAGCTTACACCAGGACCGCAACTAAAGCTA AAACTTTATAACTACTTAATTTTGGAGTTTTTCACCGGCTTTTTAACGTC AGGCTAATTAATAAGGGGCAATGTAAAACAACGAGCCGATACGCACCCCG TGGGGGAACTCAAAATTTATTTTCTAATCTTAAACCCCGAACCCGGACAT ACAACTGCAAAAATAAATTAAGTTATAAGCAATTGGCAATTTTAATGTAT TACATTTTAAATGATGTTTTTTATCCAGATTAATTTTTCTGGTCAGGACT AACGTTCGTAATTTGAAATATGACATGTTGTTACTGTATAGTGAAGCCAA TAAAAAATTCTTTGAATTGAACAAACAAAATTATAATCAATGTCGTCTCA TTAGTCGAAAAAACTAATTTCATTGACAGGTACTATATCCCGACATACAC GTTATTTTACAAGGACACACTATATAATAACATGATGTTTTGGGTCAAAA TATTAAGAACAAGTTGACAACATTTTACGGATCCTAGAACACAGAATCTA TTAGGAAATAGCACCAGAATACTTTTTGGCTTAAACCCGGCCTAAAACGA ATAAAGTTAAGAACGTCCTAGGACTAACAGATGTAACAGATAAAATAAAC CTTCTTTATATATGAACTTGTTATTAAAATAAATCAAAAGTTATCAATTA CAAACATTAGGCTGTATTCTATACCTGGCGCATGAGAAAATTCTGTCATT TTGACATTTTCCATACACTCTTAATGAGTAAAAAGTATAACACTTGAAGG CTCCATCCTTTTTTTTTCAATTGGTCTTTTGAAGTGTTTTGAATGCTTTA GTTGCCAATATCAACAGCTGTTTCGAAACCCAGGGCTGGTAACAATGATT CAATTAAGATTAGAATGTCTAAAGCTATCAAGGTATTGGTCCCTTGTCAC AGGACTCTATCGCGCCCTTTTCGCCGGTTCCATTGGGAAACTATATTTTT CTTTCTCTCATCCTAGCTGGCAAAAATTCAAAACTCATATTTATCAAGGT AGTGAATAGGGCACCCCTTAGATTTGGGAAAATCTTTTATATTATGCTTT TATATTTTTCTTTTATAAGAATACACTTTATAAGAATATCCATGATGAAA TTGACCAAAAAATTAAGAATATGCTAAGAATTCCACCATCATACAATTTG GAAACTAAGCCTCAGAATGCCATTTTTAGAACAACTTTCCTTTAGATTGC AATTATCCCCAGCAATGCTAAAAGCTCTCGCCCAATTTTAGCTTAGCATA TTGTGTGCTAAATTTAGTCTTAGTTGGGTCCTAACCTAAGAATACTGTAA GAATATTCTTGGATGATTTTTCCCAAAAAGATAAGAATATCCATGATGAA ATGGAAAAACACTATTCTTATGAAAAAAAAGCGTGTAATAGGGTGTCGAA TTGACAGTTTCGAGTGCATCGAATTTTAGTTACTCGATGAAATTTATCAA 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CATCAATGTCACCATCAATCATTATGTTCTATGTTTAGAAGGAATGCACT TAAAAACATTACCTTTCCCCCTCTTACAAAGATAAAAATATGCTCTTCTA CACAAATTTTGCACCCCCCCCCCCCCTTTNCTCATCAATGTCACCATCAA TCATATTAGGTATGTTCTTGGTTTAGAAGGAATGCACTTAAAAACATTAC CTTTCCCCTTCTTACAAAGCAACCTTGAGAATTCTTCAATTCATTATCTT GGATTAATATTACGTACGCAGTAGCGTAGCCAAGGAGGGCGCAAATTTGT GTAGGAGAGCAGATTTTTATGACACAGTAATTATCTTTTTATATTATAAA TAGATAATCACAGTGCCATAAAAATCTGCTCTCCTACACAAATTTTGCAC CCCCCTTTGGCTACGCTACTGGTACGAAGTTCAAATATTTGCTATGAAAA TCCGAGGAATTGAATGTCTGTCCAGGACAATAAGGTGTCAACTTTTGGTA CCTAATAAACGCCCCACGCTTGTTATAATTTTAACCCTCATACCTTAGGA CCTCCCCGTTTATAAATTTTTGAATATATTTGACACGCGAGTCTTCAAAG TAGAATGAACTTCTTTTTTTCCTACGAATTTCTTTCATTTAAAAACATTC AAAGTTTCCATTCCATATATGTCTTAGCGTCTCAACCGCTAAAACAAGCT GCTTTAATTCAAATTCATCGAATCTCATTTTCAAACGCAAATACTCTTCT TCTCCTTCTGAAATCTTTAAAATCCAACGATATTTTATCTTCCAGGATTA CCCACGCGTCATAAATCAATTCCCACCGGAACCATGGGCGGCTCGTTGGA CAACGTTTTAATTTCCATAACGGTTTTTTATCCAAATGATGAATCATAAA TCATCCTACTCATCTTACTCTTCATCCAATAGTTAATTTCACAGCACTTA TAACAATGGTTTTCGGTAGAGTAACAAATATTTTTCATCTTGGATGATGC TTCTTCATAACAGCATTGTATACTTTTCAAAGAACTCTCTACTGATTGGT ACAAGAATGTCATCATTCATCATTGGACTCTTCCAGAAAATGTTCGTACA TGGGGGGTTGAGGATATATAGTGGCCGGGGATAGTGAAAAATCTACAAAA TTTACCTTGTCCGGGGGGAGGGGGTAAGTTTACTCTGTTTTTGATTATCC AGGGGGTCAACTAATGCTTGTCCGGGGGATAAGACCTGCTGTCCGGGGGT TAAAAGTCACAATGTCCGTGGGACAAATTTCCAAAAAGTGTTATATCCTC CACCCCCATATTCAAATTATTTCTGGAAAAGCCCATTCCTCCTCCATTAC TTTTCTAAGACTTTCCACCCATAGCGTTGGCGATATTTATTCAAACTGTG ATACGGTAATTAGGGATGCAGCACATGAAAGGTCGACTATCATTCCTCTC CGATGCGAAATTAGCCCGCTATTAAGAGCTTCAGCGGGGGTGACCGCCAA TCCACCATCGGAGGACGAACGTCAAGGGTACGATTTTCTGGCTCTATAAG GTGCACTATAATGTTTTATAAAGTTTCTTGTGCAAAATTTTGGAAGGTCT GACTACCTTTGCTTCCCCCGGAAAAGAGAGTCAGAGTTACATAGTTATAT TTCTTCCCTGAGAAGTATTTTAATTGTTCAAAAAAAGCAATAGAATGATT TCTTGTATTATTTTGATCATGCTTTATGAAAAAAAGCTATATACCAGAAT CATGCTTCAATAAGTCACATTTCACCATGCATCAAATCGAATTCCATCAA TAATTTCCTTTCAGTTTACATAATTGATACTTTGGTTATACAAAACAACC GATCAAATTTCGTCGTAATCATCTTTTAACCAATCACGTCTTACCAAACA TCACTCATTAATAGTAATCATCATCGTAATCATCATCGTCGTCATCGTAA TGATGATGTCGGCGATGGTGTCGTCTTGGGAAATAATAATTATTGACATG GTGATGATGACGGTGATGAGGATGGAAATCATCATCCTCGTATCCAGACT TCCATCGCAAATAATCAGCAAAGTCAGCTGGGATTTGTAACCCAGCTGCT CCATTTCCTAAGTTCAAACCTGGTACAACTGGGCTTCCTGCAGGTGCAAC GTTATTGACTGCCTCTGTTCCTTGTCCTCCTTGTCCTCCCAAAGCTGTGT TTGCTTGTGCAGGGTTATTCATGAATTGGTTTGGTAATGGATACATATTC GGGTTTAATGCACCTCCGTTGTTGTTATTGTAATTCGAATCATCGGGCGA TCCTCGAGACGCCATTCCACCCGCCATTCCATTTCCAAAATACTGAGCAG GCTCATTGCCATATCTCACCACAGCTGGATTCACATTCGCTGGAGATAAG ATTCTACCAAGATTTCCATGCGCACCAACAGCTCCAGCATATCCTAAATC TCCCAAAGTGCTGACGCGACTTGCTTCTGGTATGGTAGCTGGTATATGAC CAGGTTTGGCAACAACATTCAATCCAGCAGGTTTTGCGTTGATTTTGACT CCTTCAGCATCTGCAGTGACTTGTATTTCAGGTCCTCGATCCTCCATATG GAAATGCGTTGGTTGTCCTGATTGAACAACTTCTTTCTCTTGGCAATGTA CCAAATGGTTGCTTAGATTTAAAATTACAAACATCCATAATATTTTTTGC CTTGTTTTTAAAACAAATCCCATATCTCTCTTCTTTTCTTATAATATTCT TATTTTTGAATCATTAGTAAACAAATTTAGGTGAGAATTAGTTACTTTTT AATTTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072325TCONS_00072325Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072324TCONS_00072324Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072323TCONS_00072323Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072325-proteinTCONS_00072325-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_76supercontigscaffold_76:117680..182236 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.1 0.05 0.06 0.13 0.05 0.05 7.3 7.88 2.06 2.19 4.63 2.4 5.4 5.07 3.32 9.23 5.88 5.47 1.93 1.38 2.6 2.47 1.91 1.84 4.54 4.71 0.24 0.12 0.25 0.2