XLOC_000041 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000041
Unique NameXLOC_000041
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000001:1683867..1745865+

Legend: gene
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>XLOC_000041 ID=XLOC_000041|Name=XLOC_000041|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=61999bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:1683867..1745865+ (Clytia hemisphaerica)
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GGTTTGACGTCACTAGTTTCATCTGTCATATAAACTGTTTCGAAAAGCTT ACAAAATATCAACTCTCAAAACGATTTAACATCTCTATTCCTATCTCAAA AAAACGATAATAACAAGTTGTTGTTGTCTGTGTAATGGAAATCCTGATAT TTCTTTTCCATCCATTTCTAATCGCTGTATCTATGTTAAAGTTGTTAAAA TACGAAGATTCTTTCCTGGTTATTCCATAATTAAATTACAAGTTCTGCAC CTTATGACGTGTTATTCCACACCTGTGGATGTCTTGTAACGTCATCTTGG AATCTGAcgtaattattttattttgatgacATTTTAATTAGTAAACATAT CATCATCTCATTTAACGACCGCAAACATTTTACAGACTTTAACCAGGAAA ACTTAGCATGAGAATGAGGCTGATAAAAGTACAAATTAGACCCCTTCAAA GTCATCACAATCAAATTGTTCAATTCCCAATGCGTCTTGAGTTTTGATGT CCGTTCCCAGGGAGAGAGAGGATCGGTTGAAAGATGACAACTGGTTTTGA TGAATGACTTTCGAATTGTTTAATTATTTAAATGATTAATGATATACCGA TATCATTATCCCGCAAATTAATTCATCTGATTCAAAATCTTTCTCTTGTC TTTTCATATTTACCCTCTGCCACTTTTCTCCGCattcttgaataaaaatt gctaAACAACCTAAAATTCGTCAATTTTATCGTCAATATTATGAAGAAAT TTGTTTCTTGGAAAAGCGGTTTGAGTTAGTATTAAGATTTCTTAATACCC AACTTTTAAgaaatttcaaacatttcatAAGCTATAAAACACAAGGGAAC GAGGAGCAAAATATTTATGGAATGTTATTCAAGCGAGAAAAatgacagaa aaaaaaaacattggttTAATGATGTAGTAATCGATTGGATGACAAGACAA 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ACTGAACGGCAAACTTACGCAAGGCGTACCCATGAAAGTGTTAGATACGG CCGCTTTCAAGGATTACATGCGTGAAGAAGTTGAGAAAAATGGCGGCGTC ACTGAAGACCTCAAAGATCGAATCATGTCTAAACTGAAGGTAAGCAATTT tacatttgaatttttaaaatcatatatatttctaaaaaaataacttGTCA CAGAAATATCTGATTTTAGTGGAAGCTCTATCTTGTTTATCgagcacttt ttgtgttgatttGTTCACCAAAGAAATAATGATATTTGAACTTTTGAGGA ATACGCCTTCCCGATATCGATTGTCCAATACAAAAACACAGGAAATTCAA CATTAAAGCCAGGCGTATATGTAAGTACGATTCATTTTATGTCACTTTCT TCTGCCAACCAAAGCTTATAATAAAATGTTCCCTTTCTATTCTTCAGATT TGCATGAGTTTCATCAAAGATACACACTTAGACGAAGAAACGCCGTGTTG GTTCGAAATTTGGCTTGTCAAAGTCAAGGAGCATGTTAGACGTAAGTTCT AGATCCTGCTTTTCAATTTATGTATTTACCGCCGCTAAATGAATTTCAAC AGCCTACGACTAATGGATCTGACGTTTATGGCTATACtctttaagccatt ttaatcCTGATGAAGAAATTTTGATCTTGAAAGATTGATTAAATCCAAAT TTAGTTCATCTCTTGATAttgtttctttatttctttatttcttgattttc caGGTTACCTTGACAACCAACAGAAACGAGAGAAACGAAAATCAGGACAT TTAGACATGCGTATTACACAAACACAAGAATCCGTTAAACGAATTGCAGC CATGCCTGAAATGAGGCGCGCTAAAAGCGGTGATCATTTACGTAGACCAC GAAGTAATACGGCAGGCCCGAATCCTGCCGAAACGACGGGAAAACCGGCC CGTTCATCAAGACCGCCGTCACAAATAATCGGCGAAAAATCCATCGCACG TCATCGAGGGACGACATCAGCAGACACAACGGCGCAATGGCGTGTGGAAC AAAAGATTACGCAAGAAATGTTACAACGTGAACGTAGTATGGACATGATT CGACGTGAGAAAAGCATGGACGTACGGCTGGAGTCGCGACTTTTAATGGA ACGCGAATATCGAAACAGTATGGGAAAACCTTTAGTTGAATCTCAACACG TGAACAGAGTGAGGGGTAGCGAGAAAAGTAGCCCCGGTCAAAGTCCACCG CAATCACTGGCCCGTAGTACGGGAAGCAGTATGGGATCACGTAAAGACAA TTCGACCACAGCCAACGATTCCCCTCGTATAGTTAACGGTCCACATACGC CCGTTTCACGTATGCCCGCCCACTCTCAACAAAATCCTCATGAAGAATTT CGAAGGGGCGGAAGTGTGGCGGCTGCCCGTGAAGGAATGAGTTATCGACA AGTATTTGGACTTCAATCATCAGACTATTTATTTAACGTGACGCCGCCTA ATTACACGCGCCATCGACGTTTCTCAGACTCAGATACTGAATCCCTtcac aatttcaatttcatacaCAAAGTAATCACACAACCTTCAACGCCCACTCA CCAATCCACCCAACAATTAACAAACGCCCAACAAACGCCCTCCCAACAAA CAGAAGATCCGAAGAAATCGAAAGTACTTCAACAACCGAAAAGttggatg aaaaaagtacgACGAAAGTCGGAAGATAATCCAAAACGAAAAGTTGTAGC GCAACTTTCTAACAAATAAATAGATAGGATGagatattttgacttttaga tGAACATATTATTTTTAGGAGAGGAATTTAAGTCTTTTTGCTTAATATTT ACATTAAGattcatttttatgacgtctAATTTTCTTAGTACTAGATATTG TATGAAATTAAGTATTCTTAGAGTGCCTTTAAACCATTTAATCTTAACTG CTAttgaaatttagaaaacttggaaatttatttggaaatttttattctca aaaattttggcTTACAAATTATCTTCAATGCAtctcaatattttttcttt ttaattttctgtAATATAGTTATTGGTAAAAAAAcgaagttatttttttc tgtttcatttttgtaaattatgtGAAGAAACAAGCACCGTTATACAaag
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00000079TCONS_00000079Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000080TCONS_00000080Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000081TCONS_00000081Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000082TCONS_00000082Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000083TCONS_00000083Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000084TCONS_00000084Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000078-proteinTCONS_00000078-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001supercontigsc0000001:1683867..1745865 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
19.05 17.94 5.21 3.9 80.47 62.67 85.42 93.63 35.55 73.31 48.08 39.58 51.64 39.24 36.73 37.01 49.11 56.18 36.43 40.66 39.33 43.41 23.79 23.34 44.85 44.52 252.49 205.34 163.9 155.43