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protein sequence of transcript:BL97039_cuf12 >transcript:BL97039_cuf12-protein ID=transcript:BL97039_cuf12-protein|Name=transcript:BL97039_cuf12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=407bp
DMKTGGRQEIKLSEGINILLTIDRDADHLNFIIDLGLKACHDGDCFLEVD IFDDLVLPIPICNVNASLTVPSIDDFVDKLAGEVSQTAVDIILKQLGLQQ VFLPVGEVAQLPANSNGSSGCPLFDIDFSGLPDPVQCQLDSNCLGVNCVL SVSIRDYVTLSTLAYVSLDACNYEFSMKLGHWSYEVSLLTYNWGEIRTKE VANNALDITYSIRKDSGAKEFVLDVVIDLCIENTCIRTIPLLQNTRIPQP FCNPDGFALPGGSIDGYLDYLEEQGQSALVTVTDAAVDVLLEKLGLSDVI STDGEPCYRPIVLQNGWAEIDKCNQLKPPQLPDTMACTVIDSCMGVECCL DLDFKLIKLTVTSNVHLDFCSYKLLMSIGNVDFEQTLFTYEWGTYMLKHF DLKKFVF Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000454:80948..88267- Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL97039_cuf12 ID=transcript:BL97039_cuf12|Name=transcript:BL97039_cuf12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=7320bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000454:80948..88267- (Branchiostoma lanceolatum) TGATATGAAAACAGGAGGCAGACAGGAAATCAAGCTTTCTGAAGGCATCA
ACATTCTCCTGACCATCGATCGAGATGCGGACCACCTGAACTTCATCATT
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GAGAATAAAGATCACATTATTTTAATATTACATCTTAAACATGTTGAAGA
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ACTTGAACTTGACTTTATTCAACTGTGTGAAGCAACCTTAGACTCCCCCG
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ATTGAGCCCTGTAATAATGATTCGTGCTTTTCAATTGAAGTTTTAACAGA
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TATCCTCTCAGAAGGTAAAGTTTTATTAACAATCAGAGGCATTGATGTGC
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TACGTTACTCGAATAGGACGTTAAATAGATGCCCCGTGTTTGAGGATAGC
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TTTAGTGTTAGTGGTTCTTAACCTTATCCAGACGGGGGGGGGGGGGGGGC
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AATAATGGTTTAAGTTTATAACTTTCTCATGTTGCCATGGCAACGGGTTT
CTGACTGGCATTTTATGCAAAAATTATTAATTTTTTGAAAACAATGATAT
TTCTCGGGTTTTCTTCCACAACTACACTAGTTTTCCTGCATGTATAACAT
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ATTAGGTTCTCGGAAGTGCTGATTACAGGCTCCTTGCAACTCGGCCCCTT
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TGATAAGGCGCTGTGGCCTATAGTTGTTCAACAAAGTAAGATGAAAGTTT
TGTTTGACTTTATGTTTTCTCAGGATGTCCATTGTTTGATATTGACTTTT
CCGGACTGCCAGATCCTGTTCAGTGTCAGCTGGACAGTAACTGCCTGGGT
GTCAACTGTGTATTGAGCGTCTCCTTACGGGACTACGTCACATTGTCAAC
CTTAGCTTANTCATAATTACGTCATATTACGTCATAACGTCACCAAAATT
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TGATACATCATACCGTTCGGAAATTATGAGGGGGGGGCCGAATCAGCCCC
CCCCCCCAGTCCCAGATATACCAAAAAAGCTCAGTCTGGATAGGGTTAAT
CTTACAGTTCGATGACCGCAACTCATGTTAAAACTGTTGTATTAGGTTCT
CGGAAGTGCTGATTACAGGCTCCTTGCAACTCGGCCCCTTGCTGAGATGA
GAGAGGAGTCGGCTCTAATATAAAGATGACAATATGTTATTGATAAGGCG
CTGTGGCCTATAGTTGTTCAACAAAGTAAGATGAAAGTTTTGTTTGACTT
TATGTTTTCTCAGGATGTCCATTGTTTGATATTGACTTTTCCGGACTGCC
AGATCCTGTTCAGTGTCAGCTGGACAGTAACTGCCTGGGTGTCAACTGTG
TATTGAGCGTCTCCATACGGGACTACGTCACATTGTCAACCTTGGCTTAT
GTCTCCCTTGACGCCTGTAACTATGAGTTTAGTATGAAACTGGGGCATTG
GAGCTATGAGGTGTCACTGCTGACGTACAACTGGGGAGAGATAAGGGTGA
GCTATATTTCATCATGTAGAATGTTTAACATACATCGTATCTTAGACCAT
CTATTACTAAACATACTAGGAAATACCGTTTTAACGTGATGGTAATAGGT
TTCAAAGTGAAGACATGAAATGTTCTGGCTTTTTGGCCACAGGCGGATGG
AAGTTTATCACCTTTTATGGGAGTTTAAAAATATTACATCACAAGTGCTC
ACAGTGTATTCAATATTTCTAACGTTTTAGAAAAAAAACTGTCTTCAAAC
TGACGTTTTTTTTTTGCATATTCAAGTTCCGCATTTGAAAGAGAAAATGA
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TCAGCCTCACGATCTTTCTCATTTAGTAGGGTTCACACGATTTCTTGATT
TTTTCCCAGACAAAAGAAGTTGCTAACAACGCTCTTGACATCACCTACTC
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ATCTCTGCATTGAGAACACCTGCATCCGAACCATCCCTTTACTGCAAAAC
ACCAGGATACCTCAACCTTTCTGTAACCCAGATGGGTTTGCATTGCCGGG
TATATTCAACATTTCTTGTTATTTTTTAAAGTCTTTCCCAGTATCACGTA
TGTAGCATAACTGCGACCCGAATTTATTAAATAATCATTATAGTTGAACA
TTTCGGTTCTTGTAAGAAAATTGCGACCTCTCAGCTAGGTTTGCAAATAA
ATTTCTTTTTTTTTCTTAAAGTTTACGAGCACTGTGAATGTTCTTGGACC
ATTTGTAAATTTGCCTGAGTTTGTTGAGTACAATATATTGCCTGTGTTGG
TTGAGTATAATACAGCATCATGCATAAACATCAAGCACTAAACATGTAAG
AACCTAACACGCTTATTGAGAAAAGTAGGGGAGACCTGGTGTGCTTGGCA
AATTACAAGCTAGCACAACATACAATGCAAAATCGACCATGTACCAGAAA
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AACATCCCATCCCCTCAGAAGTTATATCCACTAACTTGGCTTTCAGTAAG
TCAAAGTTTCCCCTGTGGATCAAGTTTAATCTACCTTAATTATGTTTTTT
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TTGTCACAGTCACAGATGCTGCTGTAGACGTGCTCCTGGAAAAACTGGGA
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AGTGTTGCTGGGAAATGATGAAGTACATATCATCTAATGAACTGAATGAA
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ATAGCTTTCCTGTTTCTGCCTCACTGTTTAGTATATCGATCGATTATTGT
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AGTTGTAGCTATTACTTTGGCCTTGTATAGAAACACTAAACCGTTCAATT
TTTAGTTGTGGCCTAGTTGTGCCTTGAGTGTTTACTCCCCTTGTTCATGT
TATCTTTGGTGGTCACTTAATGGATTTGAGGAAATTCTAACAATAGACAA
GAGTCCAACACAGACATAAATCTAAAGGCTTGGGTTAACGGGAAAGGAAT
CTATTACAAGGGATTACCAAAAGAAGATTATATTGGCCATTTTGTCCAGT
CTGTCTGTATATTTTTGTACCGTTTTCTCTCAACAGAATGCAACCAGCTA
AAGCCTCCACAGCTGCCAGACACCATGGCATGTACTGTTATTGACAGCTG
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CTGTCACATCTAATGTCCACCTGGACTTTTGCAGCTACAAGTTATTAATG
AGTATCGGCAACGTTGACTTTGAACAGACTCTCTTCACCTATGAATGGGG
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AGTTATGAAATCACATATCTGATTGTACCTATGATTAGAGCGACTGCACA
TTCAAATGTTGCTTTTGAATACTTGACAAAAGTTAACGTGATAGACAGAC
AGCATACTTGATAAAACGCAATAATCAAAATACAATGCCCAGATAGAGCT
AACCGTGTTTTAAGTTATTGCAAAATTTAAACGTGCAGTAAATTCTGTAG
ATGGTTCGCGAGATACAAAAGATAATTTTAAAGCAAATGTTATTGAGCTA
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CCATCTTAAAAAATTCCCTGAAGTGAAATAAAAAAAGGACTTTGCAATTA
TCAACTGAGTGACCCTATGTTTTATCAACCAAACAAATAGAATGAAACAA
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TCATCTGTCCATACTCTTCATGAAGTTACGTCATAGAAGCAGTCAATGCT
GTTGACGAGGACTGATGCCATACATACCTTTAAAATCCAAGTTGGCAGAC
GAACTTTTTACAAAGCATGTAATAAAACCACTTTAATTTTTTTCAGGATC
TCTTAAAACATTTACCATTGGAAATGCAATTGAGATTGACTACAGCATTA
ACAAAGATGACCTAGAGAAAATGTTTGTTGTGGATTTTGCGGTGTCACTG
TGCCTTGATGGTGACTGCTCTGAACCCTTCCCACTACTGAAGCAAAGTAG
AATCCCACAGCTAGGATGCA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000454:80948..88267- >transcript:BL97039_cuf12 ID=transcript:BL97039_cuf12|Name=transcript:BL97039_cuf12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=7344bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000454:80948..88267- (Branchiostoma lanceolatum) GATATGAAAACAGGAGGCAGACAGGAAATCAAGCTTTCTGAAGGCATCAA CATTCTCCTGACCATCGATCGAGATGCGGACCACCTGAACTTCATCATTG ACCTTGGTTTGAAAGCTTGCCATGATGGTGACTGTTTTCTGGAAGTGGAC ATCTTTGATGACTTGGTTCTACCCATCCCAATCTGCAATGTCAATGCCAG TCTCACTGTGCCATCAATTGATGATTTTGTTGATAAGCTGGCGGGTGAGG TCAGCCAGACTGCAGTTGATATCATCCTTAAACAGCTGGGCCTTCAGCAG GTGTTTCTACCAGTTGGAGAAGTTGCGCAGCTTCCTGCTAACAGTAACGG ATCTTCAGGATGTCCATTGTTTGATATTGACTTTTCCGGACTGCCAGATC CTGTTCAGTGTCAGCTGGACAGTAACTGCCTGGGTGTCAACTGTGTATTG AGCGTCTCCATACGGGACTACGTCACATTGTCAACCTTGGCTTATGTCTC CCTTGACGCCTGTAACTATGAGTTTAGTATGAAACTGGGGCATTGGAGCT ATGAGGTGTCACTGCTGACGTACAACTGGGGAGAGATAAGGACAAAAGAA GTTGCTAACAACGCTCTTGACATCACCTACTCCATTAGAAAGGATTCAGG 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TTGACTTTTCCGGACTGCCAGATCCTGTTCAGTGTCAGCTGGACAGTAAC TGCCTGGGTGTCAACTGTGTATTGAGCGTCTCCATACGGGACTACGTCAC ATTGTCAACCTTGGCTTATGTCTCCCTTGACGCCTGTAACTATGAGTTTA GTATGAAACTGGGGCATTGGAGCTATGAGGTGTCACTGCTGACGTACAAC TGGGGAGAGATAAGGACAAAAGAAGTTGCTAACAACGCTCTTGACATCAC CTACTCCATTAGAAAGGATTCAGGAGCAAAGGAGTTTGTGCTGGATGTTG TCATTGATCTCTGCATTGAGAACACCTGCATCCGAACCATCCCTTTACTG CAAAACACCAGGATACCTCAACCTTTCTGTAACCCAGATGGGTTTGCATT GCCGGGTGGGTCCATAGATGGGTACCTAGACTACTTGGAAGAACAGGGAC AGTCCGCACTTGTCACAGTCACAGATGCTGCTGTAGACGTGCTCCTGGAA AAACTGGGACTGTCTGACGTCATTTCAACTGACGGAGAGCCCTGCTATCG ACCTATAGTCCTGCAAAATGGTTGGGCAGAAATCGACAAATGCAACCAGC TAAAGCCTCCACAGCTGCCAGACACCATGGCATGTACTGTTATTGACAGC TGCATGGGTGTGGAGTGCTGTCTGGATCTGGACTTCAAGTTGATCAAATT GACTGTCACATCTAATGTCCACCTGGACTTTTGCAGCTACAAGTTATTAA TGAGTATCGGCAACGTTGACTTTGAACAGACTCTCTTCACCTATGAATGG GGTACGTACATGTTAAAACACTTTGACTTGAAGAAGTTCGTCTTTTGAGA TATGAAAACAGGAGGCAGACAGGAAATCAAGCTTTCTGAAGGCATCAACA TTCTCCTGACCATCGATCGAGATGCGGACCACCTGAACTTCATCATTGAC 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CGGGTGGGTCCATAGATGGGTACCTAGACTACTTGGAAGAACAGGGACAG TCCGCACTTGTCACAGTCACAGATGCTGCTGTAGACGTGCTCCTGGAAAA ACTGGGACTGTCTGACGTCATTTCAACTGACGGAGAGCCCTGCTATCGAC CTATAGTCCTGCAAAATGGTTGGGCAGAAATCGACAAATGCAACCAGCTA AAGCCTCCACAGCTGCCAGACACCATGGCATGTACTGTTATTGACAGCTG CATGGGTGTGGAGTGCTGTCTGGATCTGGACTTCAAGTTGATCAAATTGA CTGTCACATCTAATGTCCACCTGGACTTTTGCAGCTACAAGTTATTAATG AGTATCGGCAACGTTGACTTTGAACAGACTCTCTTCACCTATGAATGGGG TACGTACATGTTAAAACACTTTGACTTGAAGAAGTTCGTCTTTTGAGATA TGAAAACAGGAGGCAGACAGGAAATCAAGCTTTCTGAAGGCATCAACATT CTCCTGACCATCGATCGAGATGCGGACCACCTGAACTTCATCATTGACCT TGGTTTGAAAGCTTGCCATGATGGTGACTGTTTTCTGGAAGTGGACATCT TTGATGACTTGGTTCTACCCATCCCAATCTGCAATGTCAATGCCAGTCTC ACTGTGCCATCAATTGATGATTTTGTTGATAAGCTGGCGGGTGAGGTCAG CCAGACTGCAGTTGATATCATCCTTAAACAGCTGGGCCTTCAGCAGGTGT TTCTACCAGTTGGAGAAGTTGCGCAGCTTCCTGCTAACAGTAACGGATCT TCAGGATGTCCATTGTTTGATATTGACTTTTCCGGACTGCCAGATCCTGT TCAGTGTCAGCTGGACAGTAACTGCCTGGGTGTCAACTGTGTATTGAGCG TCTCCATACGGGACTACGTCACATTGTCAACCTTGGCTTATGTCTCCCTT 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CGTACATGTTAAAACACTTTGACTTGAAGAAGTTCGTCTTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000454 | genome | Sc0000454:80948..88267 - |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL97039_cuf12 |
Biotype | protein_coding |
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