|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL97021_cuf5 >transcript:BL97021_cuf5-protein ID=transcript:BL97021_cuf5-protein|Name=transcript:BL97021_cuf5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=161bp
MTPLLLFSSTLILLWSTCGAVIDITVINKFPFVLSRDSTYMKCVTPYTVT
FDALSASSVPRMSYDRALRGDEADWPGEELVIFSAARDDRIGGFQCSAGG
EEVATVKMYESASFIPSTFSLTLNRGDTATIRMTAQQTQFRLVRWKRNGV
AATSSGSTYVI Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000025:1562039..1577727- Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL97021_cuf5 ID=transcript:BL97021_cuf5|Name=transcript:BL97021_cuf5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=15689bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000025:1562039..1577727- (Branchiostoma lanceolatum)
ATTCGCCACCAGTCCCTCTTTGTACACGGAATAGTGTCGCTGTGCAAAGA
TATAATATCTCGATGTGACTTTCAAAATGACTCCCCTTTTGCTTTTCTCT
AGCACCCTTATTCTTCTTTGGTCAACATGTGGTAAGTTCATCTCTTTGTT
TATTTATTTGTTCAGACTCTTTGCGTACACAACCTCAGTTAAAGTTGGGT
ATGATACGGCGAGCTCTCATAGCCATAGTTTTCTATACCAACCTTTATGG
NGCCTTATAGACAGGCAACAATTCACATTTGTAGGATATAAATAGCATCT
TCCATTGACCCCATGACCTGGAATGTCTGTCATGTCTGATAAATGACTAG
TTCTATACCACCTCTGAACTCTACTTCCTGTACTTTTTGGCGGCATCTGT
CACCTATCAGGGGATTTACAGGAACTTCTAAACAGGCAGCAATCCACATT
TGTATAAGCTAGTTCAGAGTTGTTACTACGCATTTGCAGTGTCAAAGATG
AAGGCCCCCCAGACGTGAACAAAACCCGGCGGGGCGTTGTTATGCAAATC
AAGACAATGTCGAGACGAGCACTGTTTTCAAGCCGGGGGCCTTCACCTTT
GACACTGCTCATGCGTAGTAGCAACTCCGAACTAGCTTATAGCATATGCA
GTGTAAGAACAAGTTGAATATAACTCTCCATTTTCTCCCTACCGCGAAAT
TAAATCTTCGCGAACATTTCTGCATTTACATAACCCACAAGAACACAAAC
ATCCATGCAGATACACCAAAACAAACCCTTGATAATCCTGCAGGTTGTCT
CACCTGTGTCATGACTCTGTATTTAAACTCCCCTTTTGAGTTATCAGGTT
CATCTGAGGCCACCTGGAGCTCCAACACCTGCACAACAGGTGCAGCTGGG
CCCTTCTTAGAGACCTTAGCGTTATCTTTCTGCTTGGGAATAACAGAGAT
TTTTTTTAGACTGAGTTTAAAAATGCAATCTTTGAAACCCTTGCCTGAAG
ACTAATAACAAGTAACAAACTTTAGACAAAGTTGACAATGATACTGTAAA
TCTTTAAACTTTTGCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGTTTTTACAGTC
ACCTTTCCACTGCAAATTCATAACACCAGGAATATTTCAATGTATCATTT
TCCACTACACTACAAAATTGTTGAAAACCTCCTTTTTTCCCTACCACGAA
ATGAAAACATCGCAAAATTAGAAGAATTTATAGTATGTGCAACAAGACTT
TACCCAACTTGAAATATAAATTGGTTAGACATGAACATGATAGGTTAGAC
TTCTTTAACACTACATATAAAACCGTACAATACACCTAGAAGTACTGTAC
AATACATATAGAAGCATAAAGCTAAAAGTTTCAAAACAGTCAAATACAAA
GTAAGAAAGTATAACCTTACCTGGAACTTATATTTAAAGTCTTGACTCAC
CTGTAAGAAGACATACTTAGCCACCTCAAAGCTTCCGTCTACAAGTAGAT
GATCTCCGGAGTTAACATGTTTAAAAGCTCCATCTGGACCATTTTCTCCT
TCTTTCCACACCCTTTAGAAAAGTAAAACATGATGAATAAATTTCAAAGT
TCATTTGCATTTCTTACAAGAAAACTAATTTTATTGCAAGCCTATCATCA
TTCAGAGTTTATGTGGCTAAAAGAATATAGTATATAAGTATAATGAATAG
TATCATTATGAAAAAAATTGGCTAAACTTTCTATTCCTCGGATTGATTAG
TTGAAAAATTAAGCTTGGTGTCAGATTTTCTCATTTTCTTTCAATCAAAA
GCAGAAATTAGCCAAAACATCCCAATTTGCATCCGTGGCACTGCTTTTTA
AAACTTTTATTCAGGTTTCCTGCTTCATTGATTACATTCATCAATTAAAA
GAATCTGATTGGTGGAAATATGAAGCCTTACTTGATCTTTTTGATGTCTA
CTGTCACCTTCTTAACTTCTTCCTGCTTCAAGTTTCTCGGGGCTGGAAGC
ACATGTTAATAAATTATTTATTAACTGTTATCTAAAACTTACAAACCAAT
AAACCAATAAATATGTCGAGGTGCTGATTCCAATCTGGCAAAATTGCAGA
CTCTGCCGAGGGGCTGATTCCAATCTGGCAAAATTGCAGACTCTGCCAAT
AGAGATTGCCATCAATCTCTGTTGTAACAGTGGGGTTCAAGTGCCTCCAA
CTGACCAATAACATCAGAGTCTAACTGGTCTAGACCTTTTAGCCTAGTGG
TTGAGGCGTGCGGCCTGTGGACTGGCAGGCCTGGGTCTGATCCTCGGCAG
CCAGGAGTCTGTTCTACTCGCCTCTTTGATTCACTGTTGACAGAGATCGT
GATCTAGCCTGAGTGCCAGCATTTTTAGCTTCCGTACGCTACCCAAGCTC
CGCTCCTCGGAGCTTGGGTAGCGCAGCGGAGCTAGCGTAGCAGACGGAAG
CTAAAAAGGCTGGCACTAGGGCTAATCGTGATCAGGATCTCACCCAGTAC
AAGGGATCCTACCATTTGAGATCCTGATTCGAGTTATTACATTTTTCAGT
AAAATCAAGTTGATTTTTGCTCATGATGTCATGGTAAACATATATAGCAG
TCGGTTGGGAACTTGTTACTGTGACTCGCGAAAGACGTTCTTGAGAGAAG
CAGAAAAGCAAACAAAAATGGAAACTTGGGATGGTATGTGATTTATGATG
ATCATGCACTGTTTCCTTCTCAAAGGAATTTTTTTTTGTGAGTCGCAGTA
CTAGGTTCCAAACCAACTGCCGACTGTTTACATGAGCGGAAATTACCTTG
ATTACCTGGCTGCAGGAATCAAGAACTGGAAGTGTGATTTGTAAGAAGTG
ATGTTCAGTAACACTAGAAGGGTGTGCATTTGGTGCAAAAGTCTATGTTC
ATTGAATAATGCTATTAACTGTATCAATTATTTGATATAGTTGTGTTGTA
TTTTGGTGTCATAAGCAATTTAAAACAGTCAAACTTTTCAACTTCTTTCC
TCTTCCTAAGTTTATCAGCCAATGGCAGTTTGAGGTTATAGATAAATGCT
ATACCTGCAATTTTGCCCGTAGAAAACTCGGCAGCGACGCTCTTCCCGAC
TAATAGGAAGTTGTCTGTGTCGAGCAGCTCCTCTGACTGTACGCAGGCCT
CGATGTAGTCCAGCGGGACCACGGGCAGGCCGAGTTTCACCGCGGTCCTG
CATTTGTAGCTGTCCGTCCTTTCTTTACTCCCAAGTACGAGAAAAGAAGT
CTGGAAATGTGAATATAATTTGTAATTTTTATACTGTTTGATAGCTTAAG
ATATAAAAGACAGCATGATCTATTTCTAAAATAGACAGTTATTTTTTTTT
GTCTCACAACTTCTTTGAGGATTACAATACAAGAACAATTTTAAACTTAA
GCTCCAATACCTCCCCGAGAAGTAGTAGCCTCTTCCATTGACCCTATGAC
CTGGAATGTCTGTCATATCTGATAAACAACTGATTCCAAAACCTCCAAAC
CTACTTCCTGCTCCTTCTTCTTCTTTGACTTTGGAGGTGACCCTGGCATT
CTACGACATAAGTATCTGTTATCCGAAATTTTTCTTTTAAATATACAGCA
CATATTTTCTCATTTTGCAGAGCTCTGCTTTGTATGATTTACACGTATGG
CCAAAAACATTTTGGAAACGGGCAAAAGAACTTGATGCACGCGTGGATGT
CATTCATATCATCAAATCAACATGGCCTAACAGTTAAAAATTTGAACTCT
GACCTTTTTGTTGATGATGTAAGAGATGATGCCGTCGTTCTGAGTGATGA
GTTCCCTCAGCCTCTTCTTCTCCTTATATGGAAGTGTCACACCTGTCAGC
TCCAGGGTTACCTGGCAACCACTGAACACGCCCCTCTGTGGAAAAGACAG
CAGTGTTTAACCTTCATTCAAGTGCTTTTGAAATGTTTATGTCCCAGCAA
AGGACGGGTTGATACCTTCTACGCCAGGCGGCGTAAGCTGGCACACTCCT
TTGTGACCCGCCTCTTTGTGTCTGAAAACAGCATAATTCACCTGCTACTT
ATGTCCTATGCCATTCCGAGNTCACCTGCTACATATGTCCTATGCCATTC
CGAGGTCTCTTTTCAGATCCGGCATTCGGCCTTACTATTGTCGACTGGTC
CTTCCGCCCACACGTTTTCACACTACTTGATACGCATTGTTTGTATTATA
TGTAAATGTCTGTATATCATCTTTGTTGTTTTTAAGAATCTTAGACTGAC
AATATGCACATACATATAGAAACTTCATCACTGACACTGTCACACTGGCT
AAGGTTGTAAAAGCAAACATCTTGTTTTTTTTTGCAGTTTTTCTTAAGTG
AAGCTAGAATTTCGGACAATTTTATGATATTGCAGGTACCAAAATGCATT
TCGACGACACACACAGTAACACACATTATGTTTAACGTTACAGGGATACA
GTCACTGTATTTTTTATCTACATGTGTGTATAAAACATTAAAGATTGTTA
GTGCCTGCAATACCTTCAATAGAATACAGAAACCTTTGAATTATTTATAA
GACTTATAATAACATGAAAATGAATCAAGTCTCGGAATCATTTTCCCTTA
GACCTGTCTAAATACATGTACATGTATAGGTTATAACGTTACAATGTTGT
AAACACCCAACCCGGAAGTAAAGTGAAAATTTGGAATTTAAGAACGATCT
TCTGTAACATTTAACGCTATGATCCTGGCTTACCTGTAGGTAACATGTAG
TCAGCCTTCAGCCCTCCCCTCNCCTGTAGGTAACATGTGGTCAGCCTTCA
GCCCTCCCCTCCTCTGTATCATAGCATGTTAAAGTGTAGTCCAACAACTC
TTAATTTTGCATAATTCTCAAACATAAAATATGTAGTCTGAGAAGCACAT
CTGAGTATGCATCTGGTATTAATTAAAGAGGTTGCAGAATGAAAACCTAC
CGGTAAAAAACATGCTACGTACCTTTGGGATCGGGAACTCTCCTAAGGGC
ATCTGCAGGTCCGTACATGCACGTAGATAAAAATGACAACGCAGCTAGAA
GAATGCAGAACGTCACTTGTTCCAAACTTCCCCTTTCAGCTGTGACCTCA
TCGTCAACAAACACGTCACATGACGGTCACCGCGTAAGAACGACACCTAG
CGACATGTTTAGAAACAGCACATGAAAGTCGCCGTCTGTGAAGTGACACT
ACATGTAACGTTACATGAATCCCCAGGATCAAATGATATTGCTGAAAATT
TATGTTTCATAAACTTGAAATCAAGTCATTGGTCTTTCTTTCGAGAAAAC
CAATTGAACCCGGGTTTCTTTCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCAA
TCTTTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCGGATAATATAGTATCTAGTA
CCTATCTTTTTAATTTCAATCTATCTACCGTATCTATCTGCCTAGTCTAT
CCATCTAAGTCTATATATCTGTAAATATATCTACGCTATTTTTCATCCAT
CCAATTATCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTATCTCTATCTCTTTATTTTCATAGAGAAAAAAATTCCTTTTAAGT
CGAAGATATTTACGTAATCCGTACACCTTTTTCCTTGTAGCAAAACAATA
TTTCCAGACGATCCCCTACCCTTGTAATCCACCCAACCGTATAACAAACG
ACACTTGTTTACCGCAACAACGACAACTTACGGATGTCAACATTTGAAGC
ACCCCCTCTTCTGTCATGCGCACTAAACCAAATCAGGGACAAGTTTCCAA
CACAATTCGCCACCAGTCCCTCTTTGTACACGGAATAGTGTCGCTGTGCA
AAGATATAATATCTCGATGTGACTTTCAAAATGACTCCCCTTTTGCTTTT
CTCTAGCACCCTTATTCTTCTTTGGTCAACATGTGGTAAGTTCATCTCTT
TGTTTATTTATTTGTTCAGACTCTTTGCGTACACAACCTCAGTTAAAGTT
GGGTATGATACGGCGAGCTCTCATAGCCATAGTTTTCTATACCAACCTTT
ATGGCTAAAATCTAACAGCGAACTCAACTCAACCATTCAGGCTAAAGAAA
TTCACTGGCTACAAGAAGACTTTATTTCGCATTCACATTGTTTAGATTAA
TGTGCGTGTGCTACATAAAGCATAATGATGTACAATATCATATATTATAT
TATGGGTAGTGGCGTTTAATTTCTGCATGCTACATGATTGGCGGAATGGA
CACTATCTATGATATAGGTTGATACTTATAACTGTTGCGTGGTATAGGGA
TGTGGATGTATCAACAAATATATTTAGTTTGACAGTGATAATATTTACTG
CAAATTCCTGCCCGTTGGCTAAAATAACAACAATTATAGACAGTGTGCAA
GTATAAAGTGCGTGAATATATATGTGCGACAGACAAGGGAAGTTAAACTA
CGTTGCTAGTCTATGACAAAAACAATATTACCAATACGGGGTCGGAAAGT
CCCTCTTTGGAAGAAGTGGAAAATGAAATGGGTGATTTCAGTAGGAAGAT
AATATTCTAATTCTGTGAATGTTTCTCAACCTACGAGTAGAAAGAAAATT
CGAATACTCTATTTCGTTCGACCTCGAATTGGGGAAATAGGCACTTTCTG
TTAAAACGTTGTGTACTTCCAGCAGAAATACGTTCGGTAGNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAT
CTCGATGTGACTTTCAAAATGACTCCCCTTTTGCTTTTCTCTAGCACCCT
TATTCTTCTTTGGTCAACATGTGGTAAGTTCATCTCTTTGTTTATTTATT
TGTTCAGACTCTTTGCGTACACAACCTCAGTTAAAGTTGGGTATGATACG
GCGAGCTCTCATAGCCATAGTTTTCTATACCAACCTTTATGGCTAAAATC
TAACAGCGAACTCAACTCAACCATTCAGGCTAAAGAAATTCACTGGCTAC
AAGAAGACTTTATTTCGCATTCACATTGTTTAGATTAATGTGCGTGTGCT
ACATAAAGCATAATGATGTACAATATCATATATTATATTATGGGTAGTGG
CGTTTAATTTCTGCATGCTACATGATTGGCGGAATGGACACTATCTATGA
TATAGGTTGATACTTATAACTGTTGCGTGGTATAGGGATGTGGATGTATC
AACAAATATATTTAGTTTGACAGTGATAATATTTACTGCAAATTCCTGCC
CGTTGGCTAAAATAACAACAATTATAGACAGTGTGCAAGTATAAAGTGCG
TGAATATATATGTGCGACAGACAAGGGAAGTTAAACTACGTTGCTAGTCT
ATGACAAAAACAATATTACCAATACGGGGTCGGAAAGTCCCTCTTTGGAA
GAAGTGGAAAATGAAATGGGTGATTTCAGTAGGAAGATAATATTCTAATT
CTGTGAATGTTTCTCAACCTACGAGTAGAAAGAAAATTCGAATACTCTAT
TTCGTTCGACCTCGAATTGGGGAAATAGGCACTTTCTGTTAAAACGTTGT
GTACTTCCAGCAGAAATACGTTCGGTAGCTATAGGTTTATAACGTTCTTT
CGAAGTGGCCGTGTTTTTTGTGTGTGTTTTTAATGTTTTATCTTAAAGTT
TAATGATGTTACAAATAAATTGTGCTTAATGATGTCATTACCAACATATT
GCATGATAGGGCCTGGTCACCTTTGTCGTACGATGATTGCACGATCGCAA
ACTGGGAATTCTTAGGTTGGTCGTACAAGTTTTCTTACGGTAAAAGACTG
TCTAAAATCCTTGTCTGCGGTTGGTTCTGTCACAACCTGTTTGAAACTTC
TATGGCATAAAAATCGTACGGCGGCCTGTCGAAGACTGTGACCGCAACCG
GGTTGTTCTGTAGCATTCCTGTAACTGATAACCCTTTTCAAGTTTGTCAG
AATCCTGTTTTCGATCGTTTTTCCTCTCATCTATAGGGATGTTGCCAAGT
AATGAGACGCATTCCAGTAATATAAAACCAACTTAACGTCATCAATAACA
GTCAAAAGCGTCATTGGTAGAGTATTGATGACTACAAGGGAGGGGACTAC
TCAAAATTTGAGATAGAGAGTTCCACAAGTGATGTGCTTGATCGTAAATA
TCGTTTTCTTTTCGTCCCTCATGTCTTTTCAAAATTTAAAAAACAGTTTT
CTGAGAGAAAAAAATCACTTATGGAAAAACTAGAAAACTAGCCCTGAAAA
TATCGTCCAAAATGAAATATAGGTTTATCGATTTCCTTCTTGTCTATATG
AAATTGAATAGCTTGTTGTCACGTTAACGACAACGGACGTAATCACTGGT
TGCTTAGCAACGAGATGGAACGACTAATTGACCTATGGAGGGTTCTCTAT
CATAATCCTCTTACCAAAAGGTTGCGTCTTGTCTCTACAAGAGCGATACT
CATTGGTCAAGTGGCATAATCAGTTTTAGATGTTGTATTGTTCGAGCCGG
ATCTGATCACGTGTTTATGTACAAGGGCACTCGACTGTGAGTTCTTGATT
TTGAAAATGGCGGCGATATCAAATATTTAGTACAATGGCTTCTTGACTGC
CATTGCACTTATGTTTTGAGTTTTGGCCAGAAATGGAAGACATAGACATG
GGTTAAGAGGGGTAGAAGCACATGGAGCAGTTTGGGAGAAGAGAAAGTTG
GGAAAACGAATCTAAACATTCTTAAAGAGGAAGAAAGTGTTGGCTCTCAG
AAGTAAAGTGTACTTAAACACGTCAGATTGACGTCATTTTTTTCGATCCT
AAAGTTGATTTATTACAAACAAATATGTATTGTTCATCTACTTAGTAACG
TTAACCAAATGACATCCGTTTACCTACATGTATTAACTTCTTAGTTAACC
TATTATTTTGCTTAAGGATGACTCAATAACACATAGCATTTAGGCATCTT
TATTATCATTATTTTGTTGTTTCTTTTCAGTTTTTAATGTCATTAACATT
CATAGAATTAGCCTCTGCTGGGAGTCCATACATTTTAATTGCATTTTGGT
CTCCCCAGAAGTTTTCCACTAACTGCAATTATTTGTTGCACTTTTTTGTA
AGTAGTATAGATTTTCATGATTTTTTGTCTATCGAATATATGTTGGATTT
GGCCATTTGAAAAAAACTGCAATATTTTAATCCATATAGTAGATGTCTTT
ATCATAGCTATGAATTTTTCCAGCGGCATTTTTATAGTATATAAATCTTG
TACAGGCATATACTTTTCTTTGTGACTGATATTAGAATTAAACCAAATTG
ATATGAAAATTATAATTCATCACATTTTTAAAACATTTACATTATTGTAG
TCAAATATATTTTGCTTCAATATCAAGGAGCCGTTATCGACATCACCGTC
ATCAACAAGTTCCCGTTCGTTCTCTCGCGAGACAGCACGTACATGAAGTG
CGTCACGCCCTACACGGTGACGTTCGACGCTCTGTCGGCCTCGTCGGTAC
CCCGGATGTCCTACGACAGGGCCCTGAGAGGGGACGAAGCTGATTGGCCA
GGAGAGGAACTCGTTATTTTCTCCGCGGCGAGAGATGACCGAATCGGCGG
CTTCCAATGTTCTGCCGGAGGGGAAGAAGTCGCAACTGTGAAGATGTACG
AATCAGGTAAAAAAAAATCAATCTGATAACTTTATTACAATTTCATAAAT
TTGAAAAAAATTAATCTTACAAAAATCTTATAGATATTAATCTTATGAAT
ATTCATTTTATAATTTACTTTAAAAAATAATCTGCATTCAAATGATTTTT
GCACAATATGAATGGCAAATGCTGGCCCATTTTGAAAATATACTGATGTT
TTGGCGACGCCTCAGGTCCGGGCTTGTCTGTGAAGGTTTTTCTTGAAACG
CTAACTGGACTTTAAGCACATGCCACACAGTGAAATATTCTTGTCCGTAG
CTTTGTCGTTTTTCTTGTCACGCATGTTTGCTTTTTTACCCTGCAGCCTC
CTTTATCCCCTCAACCTTCTCCTTGACCTTAAACCGGGGCGATACCGCAA
CAATCCGCATGACGGCGCAGCAGACACAGTTCAGATTAGTCCGGTGGAAA
CGAAATGGGGTGGTGAGATTTTCTTAATTGTTTTAATAATCAAGTAATTT
TTCTCTATCATTCTATCATACTTCTGATTCCTCAGTTTGTTAATTTGGTA
AATACTAGTATATTGTAGACGATACGTTTGTGTATGCGTTTCAAAGATAT
GTGTAGACCATCTCTGCGTTCTTTTTGTACATCTTACCGACATGAATATT
TCACAGGCAGCAACAAGCAGTGGTAGTACCTACGTCATC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000025:1562039..1577727- >transcript:BL97021_cuf5 ID=transcript:BL97021_cuf5|Name=transcript:BL97021_cuf5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1932bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000025:1562039..1577727- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGACTCCCCTTTTGCTTTTCTCTAGCACCCTTATTCTTCTTTGGTCAAC
ATGTGGAGCCGTTATCGACATCACCGTCATCAACAAGTTCCCGTTCGTTC
TCTCGCGAGACAGCACGTACATGAAGTGCGTCACGCCCTACACGGTGACG
TTCGACGCTCTGTCGGCCTCGTCGGTACCCCGGATGTCCTACGACAGGGC
CCTGAGAGGGGACGAAGCTGATTGGCCAGGAGAGGAACTCGTTATTTTCT
CCGCGGCGAGAGATGACCGAATCGGCGGCTTCCAATGTTCTGCCGGAGGG
GAAGAAGTCGCAACTGTGAAGATGTACGAATCAGCCTCCTTTATCCCCTC
AACCTTCTCCTTGACCTTAAACCGGGGCGATACCGCAACAATCCGCATGA
CGGCGCAGCAGACACAGTTCAGATTAGTCCGGTGGAAACGAAATGGGGTG
GCAGCAACAAGCAGTGGTAGTACCTACGTCATCATGACTCCCCTTTTGCT
TTTCTCTAGCACCCTTATTCTTCTTTGGTCAACATGTGGAGCCGTTATCG
ACATCACCGTCATCAACAAGTTCCCGTTCGTTCTCTCGCGAGACAGCACG
TACATGAAGTGCGTCACGCCCTACACGGTGACGTTCGACGCTCTGTCGGC
CTCGTCGGTACCCCGGATGTCCTACGACAGGGCCCTGAGAGGGGACGAAG
CTGATTGGCCAGGAGAGGAACTCGTTATTTTCTCCGCGGCGAGAGATGAC
CGAATCGGCGGCTTCCAATGTTCTGCCGGAGGGGAAGAAGTCGCAACTGT
GAAGATGTACGAATCAGCCTCCTTTATCCCCTCAACCTTCTCCTTGACCT
TAAACCGGGGCGATACCGCAACAATCCGCATGACGGCGCAGCAGACACAG
TTCAGATTAGTCCGGTGGAAACGAAATGGGGTGGCAGCAACAAGCAGTGG
TAGTACCTACGTCATCATGACTCCCCTTTTGCTTTTCTCTAGCACCCTTA
TTCTTCTTTGGTCAACATGTGGAGCCGTTATCGACATCACCGTCATCAAC
AAGTTCCCGTTCGTTCTCTCGCGAGACAGCACGTACATGAAGTGCGTCAC
GCCCTACACGGTGACGTTCGACGCTCTGTCGGCCTCGTCGGTACCCCGGA
TGTCCTACGACAGGGCCCTGAGAGGGGACGAAGCTGATTGGCCAGGAGAG
GAACTCGTTATTTTCTCCGCGGCGAGAGATGACCGAATCGGCGGCTTCCA
ATGTTCTGCCGGAGGGGAAGAAGTCGCAACTGTGAAGATGTACGAATCAG
CCTCCTTTATCCCCTCAACCTTCTCCTTGACCTTAAACCGGGGCGATACC
GCAACAATCCGCATGACGGCGCAGCAGACACAGTTCAGATTAGTCCGGTG
GAAACGAAATGGGGTGGCAGCAACAAGCAGTGGTAGTACCTACGTCATCA
TGACTCCCCTTTTGCTTTTCTCTAGCACCCTTATTCTTCTTTGGTCAACA
TGTGGAGCCGTTATCGACATCACCGTCATCAACAAGTTCCCGTTCGTTCT
CTCGCGAGACAGCACGTACATGAAGTGCGTCACGCCCTACACGGTGACGT
TCGACGCTCTGTCGGCCTCGTCGGTACCCCGGATGTCCTACGACAGGGCC
CTGAGAGGGGACGAAGCTGATTGGCCAGGAGAGGAACTCGTTATTTTCTC
CGCGGCGAGAGATGACCGAATCGGCGGCTTCCAATGTTCTGCCGGAGGGG
AAGAAGTCGCAACTGTGAAGATGTACGAATCAGCCTCCTTTATCCCCTCA
ACCTTCTCCTTGACCTTAAACCGGGGCGATACCGCAACAATCCGCATGAC
GGCGCAGCAGACACAGTTCAGATTAGTCCGGTGGAAACGAAATGGGGTGG
CAGCAACAAGCAGTGGTAGTACCTACGTCATC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000025 | genome | Sc0000025:1562039..1577727 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL97021_cuf5 |
| Biotype | protein_coding |
|
