Blg00747.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00747.0
Unique NameBlg00747.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:2043953..2068898-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00747.0 ID=Blg00747.0|Name=Blg00747.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=24946bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:2043953..2068898- (Branchiostoma lanceolatum)
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TACCAAGGTCACATACTAGGGAGCCCAAAATCAACATTGACCGTTGTCTT CCTAACATCTAGCCACATAACAAATGTAATCATAATCCATCCAGAGGTTC TTGAGTTATGCTGACTACAAAAATCGGGAAAACACAAACACACACACACA CACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAAAACTATATC TCCGTTTTTGATAAAGATAATAATAAGTGTACTTTCGCCTCTACATGTCC TTGTAGTGTGACCTGGAAGTAGAAAACGTGTGCCAGGAAGCACTTCCGGT GTGGCGTCACTTCATCCCGCGGAGAATCTGCGAGTGTCCATCGGGCACCG TCTGTGACATGAGAGCCTATCCTAAAGGGGCATGCGAGGTAAAACACACT TACACACACGGACTTGATTATATTATTTTGGGCCTTAAATTCACACTCAA GAAATTGTACATGCCTCTCTTTCTTTTATCATTTATGTGCATGTATATTC TGTATATGTGGTGTTCCCGTGTGTCATGTAGTTTTGTACAGTTTTGTTAG TTGATTCGTACTACAGTAATAGTAGTTGCAATATACTTTTGTGTTGTTAA GATAATCATTGTAATAAAGTCAACTCTGTTTTTATGAAGTAATGGTCATA GTATATTATTCATTCGCATGAATCTTGTTATTATTTTCTCACGGCAGATC TTAATCAAAACATGTGAAACTGTTTTGAAATAAGCATTAAATCTCCCACG TGAATAGTCGTAATCGGTTGGTTATGGTAGTGATGGCAACCAATAAACTT AATCATGATTATACCGTGGGCGTTGTTACTCGATTACGATATAATAAGGT TTCGTTATATCACAATTATAGATGAGATTCGTTGCAATAATGACTAAAAT TATGATTGTTATCAATTTACAAATTTTCAAAATTGTTTTATTATAGAGTT AAGTAAGCCATTATGAAATTAGGTCAAAATTATACCAAATGAGGAAAAAC ACCACAAGAACACAAATCTGGTTTACTGCATATCTGCCATATATGTAAGG CCATCTGATCATGTGTTTCCCAACTCCTGTCACAATGCACAAGGTTAGAT ATCCTGTTAATCTACATCTGTTGCAAAATGTATTACTGCAATCGTTTAAA GCAATCCATTCACCCTTTCCTTAGTCCATGCGCGAGCTCTGGTACAACTC ATATCGTTAAATTAAAAAAAAAAAATGGGGGTCAGGAATTACCCGCATTG GCAGCCTTTCTAGCGCTGAATTGATGCAGGGTTTACAGGTTTCACATAAT ACACAACATGTATATATTTTATCCACACTTGCATTTTGTGGAACTGTCGC AAGGGTTTGGGCGGCTGCCATTCGGCGCCACCAGGTGACCTCAATACGAC CTTCCCCAACCGAGGTCAGGTACCCATTTACACCTGGGTGGAGTGAGGAA AGTCGTGTTAAGTGCCTTTCCCAAGGGCACAATATCTGTGACATGACAGG ATTCGAACCCGGGACCACTTGGTTCTGAGCCGAACGCTCTGCCGATGCGC CACACGATCCCACATATCTGTGTCGATAAAAGAACCTAGACTTTCCTAGC ATCGCCAAGTAATGCATATTATGTATGATTACTTGAGAACCACACCCTCA GATGAATGCAATAATTACAAACTGCCCAAAACCACGATGAGGAGTTGGAA AGACCCACTCCAGCGTTGGTATGGGTTCCGATCTACAAAATTCCTAAAAA TGCATTTGATACTCGTCTCTTTGTCATGCGGAAACAATGGTTCAACAAAA TGTCTACAGCTGCTTTTCTTTGATAGATTTCCATATAGTCCTATAAAGGC GTATGTTCCATATCCATAGGGCGTTATGCAGTGGTCCACCATTCATTGTG CCTGTGGAAAAAATCTAGAGAAATTTCCCCGGTACAATAAACCTGTAAAT ACTTATAGCTCCTGTCTTCTCTGTCGCGACCAACAGTTGGAGAGAATGTT CACTCCATCCCACTAGACATTGTGTCTACCAGAAACAGACACAAATTCAA GTCAAGGCTTAAAGCTCACCTCAGTAATGAACGTCAGCGGCCTGACAAGA ATTGATAGGCAGCTGCCAATCTGACTAGTGGCGCCAAAGCACGGTAAAAA AACAGAAATTCACAAGCAAGTTGTGATCTATGCTTTACAGACTTCAGCTT TGGTTTGATGAAAAGAAAATTATGTCTCTCAACCTTCGTTTCAATCAGAA GAAGTTTTACTGTAATGTGTAGAAGGCTGATGCTATTTCCTTTCTAAGGT TTCCAGAAAAAAAAAACCTGTCAGAAAATTCATCATGTAAAGATTTTCAA AAGCCTTGTCAGGAAATTTATCATGTGTATGATTAGATGAATGTAGTTAT CACAACCCTGCCTCCGGGCACGATGAGAAGTTCAAAGATCGCCCCTAGTG TTAACTCCATCAGCCGTGCGTGTTCGGTAAGCCCACCTCGGCAATCTCAG CGGTCGGACTCCTTTCATCATGCCGCCCGGAGTGTTGACCTTTGGTCGAT CGATGAGCCCCTCTCTGCCCACTGTAAGGAGTCGTGGCCGACCTTATTGA TTTTGTGTGGAGAAGCCGTACGTTTGGCCGAAGGGTTGAATATAGGATCC CTGATTTTATGGATGACATCCGTGCGCAAATGATTTTTGTTCGTTTCCCC AAAAGGGGGAATCGTACAAAGAAACTGCAAAATTATCAAAAAAAATTGCC TTAACTTGCAAATAAAAGGCTTCTCTCTGCCCTTTGTAAGGAATCGTGAC CAACCTTGATTTTGTGTGGAGAAGCCGTACGTTTGGCCGAAGGGTTGAAT ATAGGATCCCTGATTGTATGGATGACATCCGTGCGCAAATAATTTTTGTT CGTTTCCAAAAAGGTAACTTGCAAATAAAAGGCTCCTCTTTGCCTTTTGC AAGGAGTCGTGACCAACCTTGATTTTGTGAGGAGAAGCCGTACGTTTGGC CGAAGGGTTGAATATAGGATCCCTGATTGTATGGATGACATCCGTGCGCA AATAATTTTTGTTCGTTTCCAAAAAGGTAACTTGCAAATAAAAGGCTCCT CTTTGCCTTTTGCAAGGAGTCGTGACCAACCTTGATTTTGTGAGGAGAAG GCGTATGTTTGGCCGAAGGGTTGAATCTAGAAGCCTTGTTTAGGCACTCT GACTTGATTATATGGATGGCATCCACTGCACCTCAATGTTCGTTTTTGGC CATACTGCAGTGCAATATGAGGAAATATTTGCTTTGAATTGTAAAACATT TTCTGACAATATATGATACAGTGTTTCTTTTCTTTCCTTTTTTTGCCATG TAAAGTACAACTAAGATAAAATGTATTTGGAACCCTGAGCAAAGGTCAAA AAGGAAGATGTAAAAAAGCGACATTTTCAAAATAAATTGTTTGGCATACA CTGTTCTGTGTGGCCTGTCATTTTTTCAACCCCTTTGTCTATATATAATT AGATTTCATTATGGAGGCAGCTTTTTTTGCCCGACTTTTTTTCACACGCA TCAGTTTTGGGGTGCCCAGAGTATGCCATCCACATGATCAAATCAGTATG GCTTTACTTTCTATTGTATCATATTTCTAACTTATTCCGACCTGTCAAGA CCAATGCTGCATTGCATAGTATGTAGACATTTTATCTTACATTGCATGAA TATTCTTTTCTTTTCTTTGGTATTTCTTATTTGAATTCAGATTTCTAGAG CACGGCGGGACATGCGCAGCAAAGGGAATGTCTGGTTTCTGTTGACCCCA 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GCGATAGAACGGAACAATTACTTATACATGGCCGACTCTCTCTGCTTAAA AGTGTCACTTGCTACGTTTTGTCAAATCTTCAGAATACGTAAGCTACCAT TTCTATGAACAAAGGTAAAATAATCTGAAATAGAGTATTCGTATGTAGAA TACAGCGATGTCTACTACGAATTCAAGAGGCTGTGTTGTTGTGTTATAAC GTACAAGAAATAAACCAATCAAATGCTATGTTTCAAAGCCATTCCG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:2043953..2068898-

>Blg00747.0 ID=Blg00747.0|Name=Blg00747.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=285bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:2043953..2068898- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAGTCCCTGACTGTAGTCGCCGTGTTTGTTGTTCTGGCCGTCGGTGC
TTTTGCGCGGCCCTACTCATCCGGCAGGAAGGTTTATGGAGAGGACAGAG
AGGATCGTCTGATCCCAAGTCTGCTGGACCGGCCTCTGAAGATGTGTGAC
CTGGAAGTAGAAAACGTGTGCCAGGAAGCACTTCCGGTGTGGCGTCACTT
CATCCCGCGGAGAATCTGCGAGTGTCCATCGGGCACCGTCTGTGACATGA
GAGCCTATCCTAAAGGGGCATGCGAGCTGCTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00747.0Blg00747.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00747.0-exon-Sc0000003-1570713199:2049370..2049420Blg00747.0-exon-Sc0000003-1570713199:2049370..2049420Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00747.0-exon-Sc0000003-1570713199:2048561..2048692Blg00747.0-exon-Sc0000003-1570713199:2048561..2048692Branchiostoma lanceolatumexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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