Blg00745.12 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00745.12
Unique NameBlg00745.12
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:7964286..7981757+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00745.12 ID=Blg00745.12|Name=Blg00745.12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=17472bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7964286..7981757+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GCAAGGTACACATTTGATAAAAAAAAACCTTGTTAAAACAAGGAGATTAA ACCTCCTTGAATAAAACAGGGCTTTGTAACAAAATAGGTTGATGAACTTT GTTGACTCGTCCTTTTCCACCTTCGTGTGACCCCGTGACGTCACCTGTGT CCTTGCCACACCTGTTTACCTTTATGACGCCGACAGGTTGTTAGCTAGCC GTGAAGTCAATCAGACTGTTTCCAGGGCCTGCACATCCCAGCGGGCTGAG ACAAAATTTCCTGGGGGACATGTTGCCTCCAGAGCCGAGGAGCTAGCGTG TGTAGGCCCTGGAAACAGTTCGGTTTCCAGATCAGACGTTAGCCCGTATG TTGCCGAAATGTAGAACACATACGTGCTGGTACATGTTGACACGGTGTGG GCGTGTGTACGTAAAAGTCACATGTACCCAGGTTAACGAACTCTTAAGGA CATGGCCAACCTTGCGGTGATCAGGCCAATATATCCGCACTCAGTCAAAA TAGTCCTTAGCGAAGGCTCTAGTAGTCAATATTTTACGAACGACAATTAC TCGAAGTACCTAAAACCATGTCTATTAATTTAAAGCTATGTGCTTTTCAA CGGTTATTTCGGCCATACGGCGCCATCGGTATTTTTATATGGTATGCATT ATCCCATATGGCGCGTAGGAACACACATTTGCACTTGGTGATGCGGCCGG AAGCAAGGTAGCTCATATCACGCACCTGTTACAGACCAAGACCAAGAACC TTAAGGGAAGGAAAACAGGTAAGGCCGCTCTTTTAGCCTATCCTTGACTT TAGGATCACAAATAGAACCTTCCGTGCCAAGAATAATGTCTTTAAACAAT TGATCGGGCGCTGTAAGCATCGCTGAGGTCAATTTCATTCACTGTGAGAG CTGCGAACGTTTGAATAATGCCAACCTTACGGAAAGTTGCCGAACAAGTT 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TGTATCATTCTGGTTTTGATGAGAATGAAACAATAATTATATTGTATATG CTTGTTACATATACAATACAATTCTTAGGGAAAACCATACTTGCACTTCT TTTGAACAAGATTTTAAAAGTATCTAACACGATATTACAATTTTGCATGT TAACTAATAAAATCTAATTGTCAAATATACAACGTACATGATTCTGTTTT CTCCTTCAAGGATGTTCATACACCTTTTTTGTCGGACAAACGAAGGTCAA GTTCGATAATGGGCCTCCAGGCAGCTTTCTATGTACTTCCGGGGAACTTC ACCCTGCAAGCAGAGTGGTGCCTTTTCAATTGAAAATTCAATTCGTGGTT TGTAACGATGTTGCATGTTAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:7964286..7981757+

>Blg00745.12 ID=Blg00745.12|Name=Blg00745.12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=870bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7964286..7981757+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAGTCCCCACCCCAGCCCGGTTCCCGCCCCCAGCAGAAGAAGTACGT
TGTTGCCGGCTCCAGGGGCCTCGGAGGGGCCCAGATTTTATTCGCCGGGC
TTCTGTTGACCTTCGGGATCGTCGGAATGGTCTTACAGACCCTGGTGTAC
TTTGCAGGGGTCCCCATCTGGACTGGACTTGTGTACCTGGTGACGGGCAT
TCTGGGAGTTGTATCAAGCCACAAGAACACCAAATGTGTGCTCATCGGCC
TTCTTGCGATGTCTTGTTTGAGTGTGCTGATGACACTTTGTGGGATCACG
ACAGCCGCCATCGCTGTGGATGCGGAACCCTGGAACAACTTCCCAGGCCC
CGGGGAGTGTCACTTTAACTGGGGCAAGGAGCACTGCTCAGGCTTGGACA
TCGCCCGTTACTCTATTGACGCGGCGAACCTGCTGTTTGCGGTGGTTGAG
CTGGGCCTGTCCATCGCCACCATAGCAGTCTGCAGCCACACACTGTGTAA
GGGGGGCAGCAGGTGCTGTGGGGAGGGGGGCAGCAGCTGCTGTGGGAATG
GTAACACTGGAAACTCCTACCAGACCATGCACGAGGTTGGGCAGGGCGGA
CGGCTGGTCCCGCTGCAGAACTTTGCAAACATCAACTACGCTCCCGCGCA
CTCTGCGCATGCCCCGTCCTACGTCATCAGCAGCCCCATACCTCCTCAAC
ACGGTGGTGGACAGCAAGGGATGGCTGCAGGTACTGTGGACCAGGCTATG
GCTCAGGCGCATGCGCAACAACAACAACAGCAGAAGAACGAGCAGCAGCA
GGGTGCAGCCCCAGACGCGCATGCGCAATCTGGTTACGTCAACCCTCCAC
CGGGGTACAACCAGGCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7964286..7964618Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7964286..7964618Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7966118..7966174Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7966118..7966174Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7966577..7966735Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7966577..7966735Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7967551..7967724Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7967551..7967724Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7968574..7968630Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7968574..7968630Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7979776..7979863Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7979776..7979863Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7980512..7981757Blg00745.12-exon-Sc0000003-1570713199:7980512..7981757Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00745.12Blg00745.12-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:7964286..7981757 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00745