Blg00745.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00745.1
Unique NameBlg00745.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:7961714..7974261+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00745.1 ID=Blg00745.1|Name=Blg00745.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=12548bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7961714..7974261+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TGAAGTCACGTATGTACAGCTGGCCATAACGTGATTGTAAACACCGTCAG AAACGAGTAAGGACTTCTAAAACAAAGTCAATAATTTTCTCCGCAGTTGG AACAGTCGAGAGAGCGTCCTCAAACCACCATGGAGTCCCCACCCCAGCCC GGTTCCCGCCCCCAGCAGAAGAAGTACGTTGTTGCCGGCTCCAGGGGGCT CGGAGGGGCCCAGATTTTATTCGCCGGGCTTCTGTTGACCTTCGGGATCC TCGGAATGGTCTTACAGACGCTGGTGTACTTTGCAGGGGTTCCAATCTGG ACTGGACTTGTGGTACGACACATTTTTAGCAAAAGAAATGTATGATTGAT GTTTTTAAAAACCGTATGACACCCAAATACAACATTTTCTGATTGCATTT GGTCAAATCACGTACAAGCTTTTGGCGACGCCTCAAGGGCGACGCCTCAG GGGCGGAGCCGTTCTACTGTAACTAATAAATGATGTTGTCGGTCTCTGTC TCGGCAGTACCTGGTGACGGGAATTCTGGGAGTTGTATCAAGCCACAGGA ACACCAAATGTGTGGTGAGTTAGTACTCCGTTACTTTTTGACATCTAAGA TCACCTAAGTCAATATAGATCTTCCTACCCCCTCTACTGCCAAACGAACA ACGTTCCCATCATAGTCTCTTAGCAGATTCAGATTTACACACAACTGAAA GCATTTGAGGGTAAATATCTTGTGAAAACTTCCCTATTTCGTCGCGCGTT TGTCCAGCTTGAAAGTAGCAGTTCTTTCCTTTATGCAGCCGTTTCCTTTA TGCAGCCGATTCCACACTTGATCTCACGGTATAAGCACAATTCAGACGTC CATGCCAACTTTTTTCAAACCACTTGTTCCCCCCCCCCTCAACATGAATG ATGAACATTGAAACGAACCCATAGAGGGAAAGATGGCATGTTGATATCTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:7961714..7974261+

>Blg00745.1 ID=Blg00745.1|Name=Blg00745.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=861bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7961714..7974261+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAGTCCCCACCCCAGCCCGGTTCCCGCCCCCAGCAGAAGAAGTACGT
TGTTGCCGGCTCCAGGGGCCTCGGAGGGGCCCAGATTTTATTCGCCGGGC
TTCTGTTGACCTTCGGGATCGTCGGAATGGTCTTACAGACCCTGGTGTAC
TTTGCAGGGGTCCCCATCTGGACTGGACTTGTGTACCTGGTGACGGGCAT
TCTGGGAGTTGTATCAAGCCACAAGAACACCAAATGTGTGCTCATCGGCC
TTCTTGCGATGTCTTGTTTGAGTGTGCTGATGACACTTTGTGGGATCACG
ACAGCCGCCATCGCTGTGGATGCGGAACCCTGGAACAACTTCCCAGGCCC
CGGGGAGTGTCACTTTAACTGGGGCAAGGAGCACTGCTCAGGCTTGGACA
TCGCCCGTTACTCTATTGACGCGGCGAACCTGCTGTTTGCGGTGGTTGAG
CTGGGCCTGTCCATCGCCACCATAGCAGTCTGCAGCCACACACTGTGTAA
GGGGGGCAGCAGGTGCTGTGGGGAGGGGGGCAGCAGCTGCTGTGGGAATG
GTAACACTGGAAACTCCTACCAGACCATGCACGAGGTTGGGCAGGGCGGA
CGGCTGGTCCCGCTGCAGAACTTTGCAAACATCAACTACGCTCCAGCGCA
CTCTGCGCATGCCCCGTCCTACGTCATCAGCAGTCCCATACCTCCCCAAC
ACGGAGATGTGCAGCAAGGTACTGGGGACCAGGCTATCACTCAGGCGCAT
GCGCAACAAGAGCAGCAGAAAGACGAGCCACAACAGCATCAGAGTGTCTC
CCCAGACGCGCATGCGCAACCTGGTTACGTCAGCCCTCCACCGGGGTACA
ACCAGGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00745.1Blg00745.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7961714..7963362Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7961714..7963362Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7964403..7964615Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7964403..7964615Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7964810..7964812Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7964810..7964812Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7966118..7966174Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7966118..7966174Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7966577..7966735Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7966577..7966735Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7967551..7967724Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7967551..7967724Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7968574..7968718Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7968574..7968718Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7969153..7969336Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7969153..7969336Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7974004..7974261Blg00745.1-exon-Sc0000003-1570713199:7974004..7974261Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:7961714..7974261 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00745