Blg00683.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00683.0
Unique NameBlg00683.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:6696399..6713801-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00683.0 ID=Blg00683.0|Name=Blg00683.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=17403bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:6696399..6713801- (Branchiostoma lanceolatum)
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:6696399..6713801-

>Blg00683.0 ID=Blg00683.0|Name=Blg00683.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1518bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:6696399..6713801- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGACAGCTTAGCGCACGACAGGAAGCTCAGCGAGCTCGGCTCCAACGA
TTTCAACGATATTTTGGACACCGACGTCTTCAGACTGCCTCCAACTGACC
AGTTGGACGACCTGCCCTCTGATTGGCTGAATGGACTACTCGACGAACCC
CTGATCCCGGACAAGCCGCTGAACGATGTGTCGCTGGCGCCGCCGCCCCA
GATCCAGGCCGAGCACAGCTACTCCATGATGAGTGCTGCTGACCTGGCCA
TGGAGGAATCCCTGCGGATCAAGACAGAGGACAGCGACTTTGACATGGCG
GACTGGATGACCTCTGGACACATGGACCACGGCATGATGCACGAGGACCC
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AGCCGCTGGACCTCATCAAGATCAAGACTGAACCGACCGATCCCGACTTG
TACTTCCACACCGGTGCTGATGATTTGGATGTCCAGATGCCCCCCACACC
CCCGAGCAGTGCCAGCAGCGACTCAGAAGGAGGCTCGAGCCCCCGCGCCA
TCCCGGACAGCCCCACTCGCCCGACGTTCAGCAAACAGGCCGGACAGTCG
CACGACATGAGNGGACAGTCTCACGACATGAGCGGGAAAATGTCGCCAAC
TCCCGGACAGAGCCTGCTCACAAACTTCCAGAAACTGCCGCCTTCCGGAC
CGTTGATCCTGACTGAAGAGGAAAAGAGAACGCTGATCTCCGAGGGATAC
CCCATCCCAACCAAACTCCCACTCACAAAGGCAGAGGAAAAGTCACTGAA
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GAAAAAAGAAGGAGTATGTTGATCAGTTGGAAAAGAGAGTGGAGAACTTC
ACACATGAAAACAATGAGTTGAGAAAGAAATGCAATTCATTGGAATCCAA
CAACAAGACGTTACTGGTCCAGCTACAGAAGTTGCAGGCGCTGGTCAACA
GAGTGCCTCGTCCCTGCAGGACGAATGCCACACAGACAGGGACCTGTCTC
ATGGTCTTGGTGGTCTTCTTCGCCATATTCCTGGGAAGCTGGAGCCCCAC
CCTTTACATCCCCTCCATGTCCAGTTACCTGCCCACCCCCTTCACACACT
CAGTGGTACAGTCCAACTCCGGACCAAACCACATCGGGTTAGCAGGGGTG
CCACACTCCGGTGGTGGGGATGACTACACCACCCCTAACAGACATTCCTC
ACGAGCCCTGTTCGCGTTCACGGAGGAGGTGACAGAGGATGTGTCCCACT
TCGAGCAGGGCCTCGACCCCGTGCTCGAAAAGCTGTGGCAAGAACTGCCC
GACGACGCATACGCCAGCGTGATCAACGAAACCGACAAACCGTTGGTTCT
CTCTGGCGGGGAAGAAGACGCGACTTTCGGGTCCGGCGCCATCCTGCATC
CAGACATCGCCGCCGAGGTCTCCTCCAAGCTCATCTCCCTCGAACACAGG
GCTAACGCTACAGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00683.0Blg00683.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6713328..6713801Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6713328..6713801Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6703239..6703437Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6703239..6703437Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6702804..6702989Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6702804..6702989Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6701816..6702024Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6701816..6702024Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6701288..6701434Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6701288..6701434Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6700533..6700601Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6700533..6700601Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6699953..6700049Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6699953..6700049Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6698811..6698997Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6698811..6698997Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6696399..6697730Blg00683.0-exon-Sc0000003-1570713199:6696399..6697730Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:6696399..6713801 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00683