Blg00397.23 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00397.23
Unique NameBlg00397.23
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000570:43268..62348-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00397.23 ID=Blg00397.23|Name=Blg00397.23|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19081bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:43268..62348- (Branchiostoma lanceolatum)
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ACAAAGGAACAACGGATTTCCATGATATTTAGTATGCAGGTAGCTTAGAT AAAGATATAAACAATGAAGTGCAAATTATGCTAATTGGGACTTAATTTGC ATAGCTAATGAGGAAAATCTATATTTGCAGTGTTTTCCATTATCAGACTC AAATACATGCAACGTATGTAGTTTATGAAAAGTGGAACATCAAGAGACAA CAATTATGCAAATAAATTCCTAATTTGCATAATTAATGCAAAACACCATA ATTCATCTAATTGGAAACTTATAGGACTGTCAATATGATATTTAGTATGC AGGTAGCTTAGACAGAGATATACATAATGTAGTGCAAGTTATGCTAATTG TGACTTAATTTGCATAGCTAATGAGGAAAATCTATATTTGCAGTGTTTTT CATTATCAGACTCAAATACATGTAACATATGTAGTTTATGGAAAGTGGAG CATCAACAGATACCAATTATGCAAATAAATTCATAATTTGCATAATCAAT GCAAAAACACCATAATTCATCTAATTGGAAAATTATAGGACTGTCAATAT TGCAACATGTGTAAGTTAGATAAAGGTGTTTATGACCAAGCATAGATTAT GCAAATTTGTCTATGTTATTAAACGATATTATTATGGTTCATGTAATTTC AGGAATTTTTTTCATTTTGATGTCATTGGTGTCTTAAACACTTTAAGTTA TGCTGACTACAAATATCCGGAAACACAAACAGACAGGTACACAGACAGAC ACACAAAAACAATGTGATTATACAATATTCATTGTATAATCATAGATTGG TTTTCACACCCAGTACTTTTGGAATCTACCATGCATGCTATTGACCAGAA CTCCATTGTTTCTTCAGATACCAGTCGGTGTTACGCTACTGTGCTGAGTC GAAAGCATCACCTGAAGAACAAAGATACGGGTGTCTTCTCTGCAGAGGAG TACGACACACACCCTGAGAGATACATCTCAACGTTTGCACAAGAGGTACA TATACTGTGAATAGTTTCATCAGGTTGGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000570:43268..62348-

>Blg00397.23 ID=Blg00397.23|Name=Blg00397.23|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=978bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:43268..62348- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTGGACTGTACGCCTGGAGCAGCTGGCCAGGGGTACCACATTCCTGAT
CCAACATCACCACAACACCTGGCTTCAACATGGCAGCTCAACCCTGCGAC
TACTGTGTGGCGTCAGTCGCAACAGTAGCCGGGACTGCTCAGTTATGGCC
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CGCCCACGTGAAGAAAATAGTGCGGAAAGGAGTCAAGGTTCTGGTGCAGC
CGTCCAATAGGAGGGCGTATCCCATGCAGGAGTATGAGAAAGCCGGTGCA
GTGATCACAGAGGACTTGTCTGAAGCGTGTTTGATCATGGGGGTGAAGCA
GGTTCCCATCAGTGGACTACTGCCAGAGAAAACCTACGCCTTCTTCTCCC
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GACAGGAAAATCCGGCTGATAGATTTTGAGAAGATGACAGACGAGCGGGG
CAAAAGGGTAGTGAAATTTGGCAGGTTTTCAGGTGCCCCAGGAATGATCA
ACATCCTCCACGGCATGGGTCTGCGCTTCCTTGCGCTCGGACATCACACT
CCGTTCATGCACATCGCTCAGAGTCACAACTATCGGAACAGCGAGATGGC
GCGCCAGGCTGTCCGAGACTGCGGGTATGAGATCGCTCTTGGCCTGATGC
CCCAGTCCATTGGCCCACTGACGTTTGTCTTCACAGGGTCAGGAAATGTG
TCACAGGGGGCACAAGAAATCTTCAATGAACTTCCTCACGAGTACATCCA
CCCCGAGGACCTAAAGGAAGTGTGTGAAACTGGAGATACCAGTCGGTGTT
ACGCTACTGTGCTGAGTCGAAAGCATCACCTGAAGAACAAAGATACGGGT
GTCTTCTCTGCAGAGGAGTACGACACACACCCTGAGAGATACATCTCAAC
GTTTGCACAAGAGGTACATATACTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:52616..52792Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:52616..52792Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:50587..50671Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:50587..50671Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:49308..49454Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:49308..49454Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:43268..43431Blg00397.23-exon-Sc0000570-1570713199:43268..43431Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00397.23Blg00397.23-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000570genomeSc0000570:43268..62348 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00397