Blg00397.15 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00397.15
Unique NameBlg00397.15
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000570:24187..62351-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00397.15 ID=Blg00397.15|Name=Blg00397.15|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=38165bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:24187..62351- (Branchiostoma lanceolatum)
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TCGATGTACAATACAAATCTTAAAATGACATTGTTATCAGTCAATATTAG CTACTACAAACCATTTGTGTAATACCAGCTCAAACAAAACTCTATCTTTA CCACCTTGTCCATCGGATCCCACCAAGAAGAAGAGAATCATTGTTCAATC TTCAGAATGTTTTGATATGCCATTTAAGTGTTAAAAAAGCTCACTTGGGC TGGCTCAAAGCTTAAAAGTTACTGTAGAATATTTTACTTGAATGCAGCAA TAATGTTAGGTTTTCATATAACGTTACAAGAAGATTTCTTGCTGTATAAG ACACATAACCTGACAGCTTTGTCAGACCTGTTCATTTGTCCATAGGATTC AAAGGCAATCATACATTTCACCCCAGTGTAACCTTGAACCCATTTGAAAG TTCCTTAGACGTCTGAAAAGAAATGTTGTGTTACCTGCTGAAAAACATGC CAACTCTAGCCTTTTTTTGGTTGGCCGCTGGCAAGGGACATAAAAATTTC GTTCTGACATCAGAGTAATGAAATTCAAAACAGACTTTCTGAATTTCACA CTATTCAGTAAAAGGATGAGGGTTAGGGAGAGTCGCAAAGCCTGACGGGG GTGTTGCGGAAAAGGCTGGGCTATCTACCTGGCCTGGCTAGCTGGCCTGT CTACCACGTTAGGCTACTTGGATCCCCCCATTCATATCCCCACAAATGGT CAGACACTTTCTCAGTTGCTTTAACGTATAAAAGGAACTACATGTAGGAA AATTACAATAACATCACTTGAAGCTGACTTAATAAACAGTTTATTCCATA TTAAACTTCACAAAACTGAATAAAACTTAATATAGCACTTTAACTCAACT GATGAATAGTAACGGGGGGGGAACCATAGTCCCGAAAGGCCCATAGTCCG GTTAGGTTTTAGAAAATTTATCATTGTTGCGGAGATATGCATGGGTAACT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000570:24187..62351-

>Blg00397.15 ID=Blg00397.15|Name=Blg00397.15|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1521bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:24187..62351- (Branchiostoma lanceolatum)
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CCGTTCATGCACATCGCTCAGAGTCACAACTATCGGAACAGCGAGATGGC
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CCCAGTCCATTGGCCCACTGACGTTTGTCTTCACAGGGTCAGGAAATGTG
TCACAGGGGGCACAAGAAATCTTCAATGAACTTCCTCACGAGTACATCCA
CCCCGAGGACCTAAAGGAAGTGTGTGAAACTGGAGATACCAGTCGGTGTT
ACGCTACTGTGCTGAGTCGAAAGCATCACCTGAAGAACAAAGATACGGGT
GTCTTCTCTGCAGAGGAGTACGACACACACCCTGAGAGATACATCTCAAC
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ACTGGCCGCCGAACGCACCACGTCTCCTGACCTTCTCCGACCTTCAGCAC
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GCCCAGACTGCCTCACCGGCTGGTGGCAGTGTGCGACATCTCAGCCGATC
CCGGCGGTTCACTGGAGTTCATGACGGAGTGCACCAGTATCGATGTCCCC
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CTCTGGCAGATGCTGAAGTCCAGGGCTGATGTTTCATTTGAAGAACAAGA
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00397.15Blg00397.15-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:49308..49454Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:49308..49454Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:30654..30765Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:30654..30765Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:29098..29163Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:29098..29163Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:27305..27384Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:27305..27384Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:24187..26635Blg00397.15-exon-Sc0000570-1570713199:24187..26635Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000570genomeSc0000570:24187..62351 -
Properties
Property NameValue
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