Blg00397.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00397.1
Unique NameBlg00397.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000570:24187..62277-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00397.1 ID=Blg00397.1|Name=Blg00397.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=38091bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:24187..62277- (Branchiostoma lanceolatum)
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CCAGCTCAAACAAAACTCTATCTTTACCACCTTGTCCATCGGATCCCACC AAGAAGAAGAGAATCATTGTTCAATCTTCAGAATGTTTTGATATGCCATT TAAGTGTTAAAAAAGCTCACTTGGGCTGGCTCAAAGCTTAAAAGTTACTG TAGAATATTTTACTTGAATGCAGCAATAATGTTAGGTTTTCATATAACGT TACAAGAAGATTTCTTGCTGTATAAGACACATAACCTGACAGCTTTGTCA GACCTGTTCATTTGTCCATAGGATTCAAAGGCAATCATACATTTCACCCC AGTGTAACCTTGAACCCATTTGAAAGTTCCTTAGACGTCTGAAAAGAAAT GTTGTGTTACCTGCTGAAAAACATGCCAACTCTAGCCTTTTTTTGGTTGG CCGCTGGCAAGGGACATAAAAATTTCGTTCTGACATCAGAGTAATGAAAT TCAAAACAGACTTTCTGAATTTCACACTATTCAGTAAAAGGATGAGGGTT AGGGAGAGTCGCAAAGCCTGACGGGGGTGTTGCGGAAAAGGCTGGGCTAT CTACCTGGCCTGGCTAGCTGGCCTGTCTACCACGTTAGGCTACTTGGATC CCCCCATTCATATCCCCACAAATGGTCAGACACTTTCTCAGTTGCTTTAA CGTATAAAAGGAACTACATGTAGGAAAATTACAATAACATCACTTGAAGC TGACTTAATAAACAGTTTATTCCATATTAAACTTCACAAAACTGAATAAA ACTTAATATAGCACTTTAACTCAACTGATGAATAGTAACGGGGGGGGAAC CATAGTCCCGAAAGGCCCATAGTCCGGTTAGGTTTTAGAAAATTTATCAT TGTTGCGGAGATATGCATGGGTAACTGCACATGATAAGTACACCTAGTTA TGGACTAAACATTCATGAAAGCCACCACAAAGTTGGACTATATATATATA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000570:24187..62277-

>Blg00397.1 ID=Blg00397.1|Name=Blg00397.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1590bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000570:24187..62277- (Branchiostoma lanceolatum)
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GAGGAGGGTTGTGGCTTTTGGCAAGTTTGCAGGGGTGTCAGGAATGATCA
ACATCCTCCACGGCATGGGTCTGCGCTTCCTTGCGCTCGGACATCACACT
CCGTTCATGCACATCGCTCAGAGTCACAACTATCGGAACAGCGAGATGGC
GCGCCAGGCTGTCCGAGACTGCGGGTATGAGATCGCTCTTGGCCTGATGC
CCCAGTCCATTGGCCCACTGACGTTTGTCTTCACAGGGTCAGGAAATGTG
TCACAGGGGGCACAAGAAATCTTCAATGAACTTCCTCACGAGTACATCCA
CCCCGAGGACCTAAAGGAAGTGTGTGAAACTGGAGATACCAGTCGGTGTT
ACGCTACTGTGCTGAGTCGAAAGCATCACCTGAAGAACAAAGATACGGGT
GTCTTCTCTGCAGAGGAGTACGACACACACCCTGAGAGATACATCTCAAC
GTTTGCACAAGAGTATGCTCCGTATGTGTCCTGTCTGGTGAATGGAATCT
ACTGGCCGCCGAACGCACCACGTCTCCTGACCTTCTCCGACCTTCAGCAC
CTGCTCAGTCCAGACATGGCGCCCAAACACGTACCGGAGGGTCCGGGCAT
GCCCAGACTGCCTCACCGGCTGGTGGCAGTGTGCGACATCTCAGCCGATC
CCGGCGGTTCACTGGAGTTCATGACGGAGTGCACCAGTATCGATGTCCCC
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GCGAGTACATGAGCCGCAGTTTTGCTGGTGACGGTGTCCTGGTGTGTTCC
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GTGATTGCATCAAACGGCAGACTAACTCCAAGATTTGAGTACATCTCCGA
CCTGCGAGCACAGAAACAGAAAAAGCAAGCAAAAGCCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00397.1Blg00397.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:54489..54861Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:54489..54861Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:51461..51545Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:51461..51545Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:50173..50240Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:46196..46274Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:38295..38363Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:38295..38363Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:30654..30765Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:30654..30765Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:29098..29163Blg00397.1-exon-Sc0000570-1570713199:29098..29163Branchiostoma lanceolatumexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000570genomeSc0000570:24187..62277 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00397