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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000086:232283..243073+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg00338.2 ID=Blg00338.2|Name=Blg00338.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10791bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000086:232283..243073+ (Branchiostoma lanceolatum)
GTAACATTTCTTTACTAAACGTATGTTTTCTGAACTGACGGGTACAGTTG
TTTTGTTTGAGGTCGTAAAAGCAATGTTGTGTTCGCTTCTGTGATGTTAT
CTTAGCTCATCAAGAGTTAAGTAAAAAATATCCTTAACGCTAGTTGTACA
CCATACAGTCGTGTCGTTAGCGATAGCCTTATCTGTATCATATATTCTAA
ACGATGGTAATACCGATCAATGGGAATGTTGGTATGAGATTATACTGATT
GGAAACAGCTGGTCATTGTCAAGATTCCAAGGTAGGAAGTCATTAATAAC
TGCAAGGTACAAAGTCACAGTAATAATTCAGGTATCGCACTACGAAGATA
AACGTAATTAAAGGTGACGAAGTTATGATAACATTTAGGGCAAACATATT
CATATTTGTGCTTAACAGCAACTATTAGTATCGCAAACGTATTAATTATA
GACAATGTGACATTTCTACCTTTTGAAAGCGGAACTTCCTCTCAGCTGAA
GGTTACCCATCACCATGGCAACGTACGAGAAACGGTTGTCCCACCTGGCT
GTCATTCTCTCCGTGGTAACCATGGTGATACCTACGTCAGAGGGGAAGTT
GGGCCTGAAAGATGCGCTTCCGTCTGTTCTGAACAACGGCTTTACCTGGC
AAAATTGTGGTAGGTGGAACTGATAAAACTGCCGTAAATGCATTCACTAG
CATGATACTGAATCTTAGTTAGTCTTGCACGGTAATGATAGATTCTTTGA
ATTTTCATTGGCTTTTAGAGACAATCTCAGATCATCATTTGTCAAAAATT
GTATCACATCTCATGGATACAGTCGTGGATACCATCTGGTTATCTATGAT
ATGACGTTTTACAATACTAATAGTAAGTACCACAATGCTAATAGTAAGTA
CCACAAATATCATTATCATTACCCGTGGCACGAAAATTGAGTTAATCTGT
ATTCCTAAAAAAAGCCATAAAAACACCTTACCACTTTTGAATTGATTCAA
AGTCATTGCCACCTTTCTGTCTTCAGGCGACCCTGTCACGCAAAACTTCA
CTGTCACTGTGCTACCGAACCCACCAGTCAGAGGAGAAAATTTCCAAGTC
GGCATTACGTTTGTACCAGGTAAGATTTGCCTCTATGATAAGTTTATCTG
CACTTTTAAAAAGTGCTTTAAATCCCACCGCTGCCACAAAGTCTATGAGA
GGGTAGCATGACACTGACTGTTGGAGGAGGAGAAGACCATCCATGGCCAT
TGTGATGGGGCAGGGTGTACAGAATGAGTATTAAACGACGGTGTAGTACT
AGTTGCATTTAACAGCATCCGACAGGGGGCACTCTTGGCTAGCGCTAAAA
AGAAACGTGTCATATATTTGACTTATATGTACAGCGATAACCCATCGGTA
ATCGGCGGTATTCTTCCCGTTAGTAATTTAGATTTTGGAACGGACGTACA
GGATATGCATTAGTGTGTGTGATCTATATCTTTACCCTGTGGGTATATTT
GTGCGCTTTTGACTACAGAAATTTTTGTGACTTTGATACCGTAGATGCTG
ATCTCACGATCGGGAGAGTTGACGTGGACTTCTGGCACAACTATCGCCCA
GCGTTCTCCGTTCCCTACCCTATCTGTAAGAAAGGCACCAAGGAAGAACA
CTGTCCGATGAAGAAAGGAGGTAACAACACTGTCTGTTGTTGTATAAACG
TTAACGTTAACTGGAAGTGTAACGTTACAGGTGTTGCTAATCATTTTCAA
CATGTGTTATGTCTGGTTTCTTACGCGTAACGTTTAGATGATATTTGCAT
GACTGTGTTCCGTTTATTGCTAGATTCAGTGGTAAACGTTTGTCCTTCTT
AGGGGTAGACTTCTTTATCATTTGATAAGACAGGGGCGTTCTTTTGGATA
TTGCATGTATCAAACGATTCTCAGTATACGATAAGTAGGTTTTCGCTCGA
TAATGTCATACCATTTAATGCAGATCTATTCCACCATTACAAAAAGGTAG
TATTTTAGTCATTGCTAGCCCTTCTATCTTATTTGCTATTGTATGTGTTA
TGTCTGGTTTCTTACGCGTAACGTTTAGATGATATTTGCATGACTGTGTT
CCGTTTATTGCTAGATTCAGTGGTAAACGTTTGTCCTTCTTAGGGGTAGA
CTTCTTTATCATTTGATAAGACAGCGGCGTTCTTTTGGATATTGCATGTA
TCAAACGATTCTCAGTATACGATAAGTAGGTTTTCGCTCGATAATGTCAT
NGGAAGAACACTGTCCGATGAAGAAAGGAGGTAACAACACTGTCTGTTGT
TGTATAAACGTTAACGTTAACTGGAAGTGTAACGTTACAGGTGTTGCTAA
TCATTTTCAACATGTGTTATGTCTGGTTTCTTACGCGTAACGTTTAGATG
ATATTTGCATGACTGTGTTCCGTTTATTGCTAGATTCAGTGGTAAACGTT
TGTCCTTCTTAGGGGTAGACTTCTTTATCATTTGATAAGACAGCGGCGTT
CTTTTGGATATTGCATGTATCAAACGATTCTCAGTATACGATAAGTAGGT
TTTCGCTCGATAATGTCATACCATTTAATGCAGATCCATTCCACCATTAC
AAAAAGGTAGTATTTTAGTCATTGCTAGCCCTTCTATCTTATTTGCTATT
GTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNGGCGTTCTTTTGGATATTGCATGTATCAAACGATTCTC
AGTATACGATAAGTAGGTTTTCGCTCGATAATGTCATACCATTTAATGCA
GATCCATTCCACCATTACAAAAAGGTAGTATTTTAGTCATTGCTAGCCCT
TCTATCTTATTTGCTATTGTATGAATGTGATGATATATGGCGGAATTCCA
TTTCCCCACCTCTGACGTGGGAGAGTCTAAAATTGTTTTATATGTTCTAA
CTCCTAACTGATGCATTTTTTTTCTGTCGGTAGTCCTGGAGACGATAAAG
AGCAAACCTCAGATTTTGCCGAAGCACGTCGAACCGGTAAGTCGGATGAT
AACCTATAATTAGCTACGGGCCCATGGCCACACAGCTGGGCTATTTCAGA
CGCGAGATCGAATGTCTTTCTTGGCAGAGTAATTTACAGATATTCCAGAT
TGTTTTTATTCGTATAACCAGCATTTCCTCAAATATGAAACTTCATGAAT
ATAGTTCACTCATACATACAAACACACAAACACATTCACTCACACGCACA
CACACATACACACACACACACATTCACTCACACTCACGCACACATAATCA
AACGCGTACACACATACTCACACAATTAAACAGAGGTACATCGTGAAACA
CACACATACACGTACATGTATACATACATACACAGCTCCACACATGCGCG
CGCACACACACATATACTGTACATTACACACACACACACATCAACATAAT
CTAACGTGTCTGTACCCGTCCTACCAGGGTCACTACAACGCCACCGTCAC
CTTGTTGAACCAGGCCGGGCATCAGATGTTGTGCGTCACGGCAGAGGGAG
ACCTGAAGTAGGGCGGCAGAGAGACGGCCTCCACACTAAAATACAACGAC
ACGATGTGCCAAACGATGCAAAATATTAAGAAAAGAAAAACGGAACAAGA
CGTTTTGACGTTTATTTGTAAAAGATGAAACACAAGTCAATAATCTATGA
TAGGTGTTATGTTGTTTCTGTTGATTATTATCAATGCTCTATGGAAACTT
GCAATATTTGAAAAACCATACGAGAGGAAATACCGAGACTCAAACCGCAA
ACAGGAACCGGACATAATCAATAAAGATGGAACTGAAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000086:232283..243073+ >Blg00338.2 ID=Blg00338.2|Name=Blg00338.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=501bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000086:232283..243073+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAACGTACGAGAAACGGTTGTCCCACCTGGCTGTCATTCTCTCCGT
GGTAACCATGGTGATACCTACGTCAGAGGGGAAGTTGGGCCTGAAAGATG
CGCTTCCGTCTGTTCTGAACAACGGCTTTACCTGGCAAAATTGTGGCGAC
CCTGTCACGCAAAACTTCACTGTCACTGTGCTACCGAACCCACCAGTCAG
AGGAGAAAATTTCCAAGTCGGCATTACGTTTGTACCAGATGCTGATCTCA
CGATCGGGAGAGTTGACGTGGACTTCTGGCACAACTATCGCCCAGCGTTC
TCCGTTCCCTACCCTATCTGTAAGAAAGGCACCAAGGAAGAACACTGTCC
GATGAAGAAAGGAGTCCTGGAGACGATAAAGAGCAAACCTCAGATTTTGC
CGAAGCACGTCGAACCGGGTCACTACAACGCCACCGTCACCTTGTTGAAC
CAGGCCGGGCATCAGATGTTGTGCGTCACGGCAGAGGGAGACCTGAAGTA
G
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:232283..232941 | Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:232283..232941 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:233309..233401 | Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:233309..233401 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:233827..233952 | Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:233827..233952 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:242216..242268 | Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:242216..242268 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:242710..243073 | Blg00338.2-exon-Sc0000086-1570713199:242710..243073 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000086 | genome | Sc0000086:232283..243073 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg00338 |
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