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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000086:232067..243071+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg00338.0 ID=Blg00338.0|Name=Blg00338.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11005bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000086:232067..243071+ (Branchiostoma lanceolatum)
CAAAACTAGGCTTAAGTTCCTCCTGTTTCTGTTCCGCATTCTGAGTCGAT
CAACAAGCCGATCTAGCTCACATAACCCGTCTGGAGGCATAACCTGTAAG
GTAAGAAAATATCTCATTCCAATATTTCTTTTCATTTCATTTTCTCTACA
GTCTTAATCTTTGGGTCTCCAATGACACAAGACAAAATGAATATGGCCTT
AAAAAGCAAGCAGCTTGTAACATTTCTTTACTAAACGTATGTTTTCTGAA
CTGACGGGTACAGTTGTTTTGTTTGAGGTCGTAAAAGCAATGTTGTGTTC
GCTTCTGTGATGTTATCTTAGCTCATCAAGAGTTAAGTAAAAAATATCCT
TAACGCTAGTTGTACACCATACAGTCGTGTCGTTAGCGATAGCCTTATCT
GTATCATATATTCTAAACGATGGTAATACCGATCAATGGGAATGTTGGTA
TGAGATTATACTGATTGGAAACAGCTGGTCATTGTCAAGATTCCAAGGTA
GGAAGTCATTAATAACTGCAAGGTACAAAGTCACAGTAATAATTCAGGTA
TCGCACTACGAAGATAAACGTAATTAAAGGTGACGAAGTTATGATAACAT
TTAGGGCAAACATATTCATATTTGTGCTTAACAGCAACTATTAGTATCGC
AAACGTATTAATTATAGACAATGTGACATTTCTACCTTTTGAAAGCGGAA
CTTCCTCTCAGCTGAAGGTTACCCATCACCATGGCAACGTACGAGAAACG
GTTGTCCCACCTGGCTGTCATTCTCTCCGTGGTAACCATGGTGATACCTA
CGTCAGAGGGGAAGTTGGGCCTGAAAGATGCGCTTCCGTCTGTTCTGAAC
AACGGCTTTACCTGGCAAAATTGTGGTAGGTGGAACTGATAAAACTGCCG
TAAATGCATTCACTAGCATGATACTGAATCTTAGTTAGTCTTGCACGGTA
ATGATAGATTCTTTGAATTTTCATTGGCTTTTAGAGACAATCTCAGATCA
TCATTTGTCAAAAATTGTATCACATCTCATGGATACAGTCGTGGATACCA
TCTGGTTATCTATGATATGACGTTTTACAATACTAATAGTAAGTACCACA
ATGCTAATAGTAAGTACCACAAATATCATTATCATTACCCGTGGCACGAA
AATTGAGTTAATCTGTATTCCTAAAAAAAGCCATAAAAACACCTTACCAC
TTTTGAATTGATTCAAAGTCATTGCCACCTTTCTGTCTTCAGGCGACCCT
GTCACGCAAAACTTCACTGTCACTGTGCTACCGAACCCACCAGTCAGAGG
AGAAAATTTCCAAGTCGGCATTACGTTTGTACCAGGTAAGATTTGCCTCT
ATGATAAGTTTATCTGCACTTTTAAAAAGTGCTTTAAATCCCACCGCTGC
CACAAAGTCTATGAGAGGGTAGCATGACACTGACTGTTGGAGGAGGAGAA
GACCATCCATGGCCATTGTGATGGGGCAGGGTGTACAGAATGAGTATTAA
ACGACGGTGTAGTACTAGTTGCATTTAACAGCATCCGACAGGGGGCACTC
TTGGCTAGCGCTAAAAAGAAACGTGTCATATATTTGACTTATATGTACAG
CGATAACCCATCGGTAATCGGCGGTATTCTTCCCGTTAGTAATTTAGATT
TTGGAACGGACGTACAGGATATGCATTAGTGTGTGTGATCTATATCTTTA
CCCTGTGGGTATATTTGTGCGCTTTTGACTACAGAAATTTTTGTGACTTT
GATACCGTAGATGCTGATCTCACGATCGGGAGAGTTGACGTGGACTTCTG
GCACAACTATCGCCCAGCGTTCTCCGTTCCCTACCCTATCTGTAAGAAAG
GCACCAAGGAAGAACACTGTCCGATGAAGAAAGGAGGTAACAACACTGTC
TGTTGTTGTATAAACGTTAACGTTAACTGGAAGTGTAACGTTACAGGTGT
TGCTAATCATTTTCAACATGTGTTATGTCTGGTTTCTTACGCGTAACGTT
TAGATGATATTTGCATGACTGTGTTCCGTTTATTGCTAGATTCAGTGGTA
AACGTTTGTCCTTCTTAGGGGTAGACTTCTTTATCATTTGATAAGACAGG
GGCGTTCTTTTGGATATTGCATGTATCAAACGATTCTCAGTATACGATAA
GTAGGTTTTCGCTCGATAATGTCATACCATTTAATGCAGATCTATTCCAC
CATTACAAAAAGGTAGTATTTTAGTCATTGCTAGCCCTTCTATCTTATTT
GCTATTGTATGTGTTATGTCTGGTTTCTTACGCGTAACGTTTAGATGATA
TTTGCATGACTGTGTTCCGTTTATTGCTAGATTCAGTGGTAAACGTTTGT
CCTTCTTAGGGGTAGACTTCTTTATCATTTGATAAGACAGCGGCGTTCTT
TTGGATATTGCATGTATCAAACGATTCTCAGTATACGATAAGTAGGTTTT
CGCTCGATAATGTCATNGGAAGAACACTGTCCGATGAAGAAAGGAGGTAA
CAACACTGTCTGTTGTTGTATAAACGTTAACGTTAACTGGAAGTGTAACG
TTACAGGTGTTGCTAATCATTTTCAACATGTGTTATGTCTGGTTTCTTAC
GCGTAACGTTTAGATGATATTTGCATGACTGTGTTCCGTTTATTGCTAGA
TTCAGTGGTAAACGTTTGTCCTTCTTAGGGGTAGACTTCTTTATCATTTG
ATAAGACAGCGGCGTTCTTTTGGATATTGCATGTATCAAACGATTCTCAG
TATACGATAAGTAGGTTTTCGCTCGATAATGTCATACCATTTAATGCAGA
TCCATTCCACCATTACAAAAAGGTAGTATTTTAGTCATTGCTAGCCCTTC
TATCTTATTTGCTATTGTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCGTTCTTTTGGATATTGCAT
GTATCAAACGATTCTCAGTATACGATAAGTAGGTTTTCGCTCGATAATGT
CATACCATTTAATGCAGATCCATTCCACCATTACAAAAAGGTAGTATTTT
AGTCATTGCTAGCCCTTCTATCTTATTTGCTATTGTATGAATGTGATGAT
ATATGGCGGAATTCCATTTCCCCACCTCTGACGTGGGAGAGTCTAAAATT
GTTTTATATGTTCTAACTCCTAACTGATGCATTTTTTTTCTGTCGGTAGT
CCTGGAGACGATAAAGAGCAAACCTCAGATTTTGCCGAAGCACGTCGAAC
CGGTAAGTCGGATGATAACCTATAATTAGCTACGGGCCCATGGCCACACA
GCTGGGCTATTTCAGACGCGAGATCGAATGTCTTTCTTGGCAGAGTAATT
TACAGATATTCCAGATTGTTTTTATTCGTATAACCAGCATTTCCTCAAAT
ATGAAACTTCATGAATATAGTTCACTCATACATACAAACACACAAACACA
TTCACTCACACGCACACACACATACACACACACACACATTCACTCACACT
CACGCACACATAATCAAACGCGTACACACATACTCACACAATTAAACAGA
GGTACATCGTGAAACACACACATACACGTACATGTATACATACATACACA
GCTCCACACATGCGCGCGCACACACACATATACTGTACATTACACACACA
CACACATCAACATAATCTAACGTGTCTGTACCCGTCCTACCAGGGTCACT
ACAACGCCACCGTCACCTTGTTGAACCAGGCCGGGCATCAGATGTTGTGC
GTCACGGCAGAGGGAGACCTGAAGTAGGGCGGCAGAGAGACGGCCTCCAC
ACTAAAATACAACGACACGATGTGCCAAACGATGCAAAATATTAAGAAAA
GAAAAACGGAACAAGACGTTTTGACGTTTATTTGTAAAAGATGAAACACA
AGTCAATAATCTATGATAGGTGTTATGTTGTTTCTGTTGATTATTATCAA
TGCTCTATGGAAACTTGCAATATTTGAAAAACCATACGAGAGGAAATACC
GAGACTCAAACCGCAAACAGGAACCGGACATAATCAATAAAGATGGAACT
GAAAT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000086:232067..243071+ >Blg00338.0 ID=Blg00338.0|Name=Blg00338.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=501bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000086:232067..243071+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAACGTACGAGAAACGGTTGTCCCACCTGGCTGTCATTCTCTCCGT
GGTAACCATGGTGATACCTACGTCAGAGGGGAAGTTGGGCCTGAAAGATG
CGCTTCCGTCTGTTCTGAACAACGGCTTTACCTGGCAAAATTGTGGCGAC
CCTGTCACGCAAAACTTCACTGTCACTGTGCTACCGAACCCACCAGTCAG
AGGAGAAAATTTCCAAGTCGGCATTACGTTTGTACCAGATGCTGATCTCA
CGATCGGGAGAGTTGACGTGGACTTCTGGCACAACTATCGCCCAGCGTTC
TCCGTTCCCTACCCTATCTGTAAGAAAGGCACCAAGGAAGAACACTGTCC
GATGAAGAAAGGAGTCCTGGAGACGATAAAGAGCAAACCTCAGATTTTGC
CGAAGCACGTCGAACCGGGTCACTACAACGCCACCGTCACCTTGTTGAAC
CAGGCCGGGCATCAGATGTTGTGCGTCACGGCAGAGGGAGACCTGAAGTA
G
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:232067..232166 | Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:232067..232166 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:232778..232941 | Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:232778..232941 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:233309..233401 | Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:233309..233401 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:233827..233952 | Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:233827..233952 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:242216..242268 | Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:242216..242268 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:242710..243071 | Blg00338.0-exon-Sc0000086-1570713199:242710..243071 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000086 | genome | Sc0000086:232067..243071 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg00338 |
|
