Blg00143.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00143.0
Unique NameBlg00143.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000026:2518458..2535649+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg00143.0 ID=Blg00143.0|Name=Blg00143.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=17192bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:2518458..2535649+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TGAAACTAAAATATCACCATGTAGCTTATTTTTGTGCCTCTTTTGAGCAC TTTTGATAAGAAATCTGCCCGCAAATATGGTAATCAGTGGCATTTAATGT CAATTTCATAAAGATTACAGTAACTAGAATATTTCCAGTTTTCAAGCCTC ATGAAATGCTCTGGGTGCCTTTAAACAATTATAAATGCTTTGACATTCAA AATCATTGATAATACTTTTATTAATTTATTCATTTATTTATTTCAATTTC TGTCTGATGTTATCCAGGGGTTCCCCCACCTCCCCAGTATGTAGCACCTG AGGACTACACCAAACCTCCTGAGCAATATGCTGAGTAAGTATATGTAACA ATTAACTCAACTCTTCTCTCTTTGCTTCATATAAACTGCATTTAAGTTTG CGGTGATTTAATCTTGCGATAGGGAAAAAATGGAGTGTTTGAAGTGGTTT TAAGTTTGTGGGGAAGAGTTAACTACAAAACCACAGAAAATTAAGCCACC GCAAACATCTTAACATTTACAGTATAACAATTACACTTACAGCAAAGGCT TCTGTTGGAAAATTAAGAGTGTAGTTCAAAAACATAATGAACATTTTTTT TCATCGTTAGGCCACACCATTTTAATTTCTTGGTTAACAGAATTTAAAAA AAAATGCTAGATTGGAAAATCCACTGGAAAACAGAATCTCAGAGGAAAGT TTGTACTTTGGTGCACACAATTTCAGGGAGTGAACAGGGTCAGGTGCAAG TTTTCACCCCTGTCTTCTGTTTTTATGATTTTTTATTTTTTTCTAAAATT ACAGAAAAAAATAAATCTTTTAACCAAGAAATTAAATTGGTGTATTGTAT TGTATTGAATTGTATTAACAATGTATTATGATAGTGTAATGATTTTACTG CAGGCTATGTATATAAGTTGTATGTTCGTCTGTATTTGTGGGTCAGCCGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000026:2518458..2535649+

>Blg00143.0 ID=Blg00143.0|Name=Blg00143.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1272bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000026:2518458..2535649+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAGCTACCCACCACCTCAAGCAGGTTATCCTCCCAACCAGCAAGGTGG
CTACCCCCCTCCACAACAGGGGGGTGGCTATCCTCCTCCACAACAAGGGG
GTGGTTACCCCCCACCACAACAAGGGGGTGGTTATCCCCCTCCACAGCAA
GGGGGTGGTTACCCCCCTCCGCAACAAGGGGGTGGCTACCCCCCTACACA
ACAGCAAGGCAACTTTGCCCCCAACCAGCCAGGAGCAGTCCAGCATCAAC
CTTGGCAACCCAACTCGGGTGAGAGTGCCCAGCCCGGCTACACCGGTGAC
GACGTCCCCGACTCGGACCCTGAGGACAACGAGGACGCTGCTGACGACGC
GGGACCGGACCCCGACATCAGCGAAATTGGCGGCGTGCAGGGATATGAAC
AAGTGGGGATGAATGACTGGGTTCCCCCACCTCCCCAGTATGTAGCACCT
GAGGACTACACCAAACCTCCTGAGCAATATGCTGAGGGAGCTGGCCTATC
AGAGCAGGAAGCGAGAGATGCGATGATCCAGTTTGTGGCAGAACACTGTT
GTTACGGAAAGAAACCTGCCCAGGAACATGTCATCAAGGCGATCAAACCC
TCAACTGCCTTCCATTACACTATGGAAACTTTCCTTGAGAGCAGATCTAC
TAAGTGGGTGCATACACCATACCGAGGCCAAATTATTGATGGCCCACAGA
ATGGTTATCCACCCAGTCCATGGGATATTGTCTGCACTTGTGCTGACCTG
TTTCAGGACCAAGTTGAGCGCATAGAGGTGCCGCACACGGCAAAAGTACA
GCAATGCCACTCTTGTTATGGGCGTGGGTTCAAGCGCTGTCCTCGATGCC
ATGGCAGGGGAAGGGTTCGTTGTTCCTCGTGCCATGGGAGGGGGCACAAG
AGGAGGTATGACCACCAGACCAAGCAACATCACAATGAGACCTGTCATTG
GTGCCATGGGTCAGGCAGGAGAAGGTGTGTGAGGTGTGGTGGAGATGGCA
GAGTGACATGTAATGTCTGCGACGGTTGCCGCGATCTGAAGTGGTACATT
CAACTGACAGTCAAGTTTGAGGATATGGTGTCTGATCATGTGACAGAAAG
GACTGACATGCCCGATGAGCTCATCAAGGATGCAGGAGGGATGGTCATCT
TCCAACAGACTCTGATCAGGGTGTGGCCGATCACTCACTTCACCGATCCG
GACGTGAATGCCAACTCCCAGATGCTGCTGGGGTTGTGTCATCCTGTGAG
GTGGAGCGTCCGCTACACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2523921..2524088Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2523921..2524088Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2525375..2525441Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2525375..2525441Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2526248..2526377Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2526248..2526377Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2530182..2530291Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2530182..2530291Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2530701..2530793Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2530701..2530793Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2531635..2531737Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2531635..2531737Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2532734..2532785Blg00143.0-exon-Sc0000026-1570713199:2532734..2532785Branchiostoma lanceolatumexon
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00143.0Blg00143.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000026genomeSc0000026:2518458..2535649 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00143