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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000280:240371..255245+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg00037.5 ID=Blg00037.5|Name=Blg00037.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14875bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000280:240371..255245+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATCTTACTGCCTTTCCCTTGTCCTGCTGTTGAACAGGTTCCCCCACC
AGGGTACAGGGCTGAGGAAATCGAGATTTGGGGTGAATTGGTCCACCCAA
AGATCAACAGAATGTACGGCATCCTGAGGGAGAGAAACTTCTACTACTTC
ATGGAGTACATATATGGTACATATTTGAGAACATAGAGAAGAATGTGATG
AAGATTTGAACATATATATATATTATTTTGCATCACACTTTCACTCATTA
ACTAATTTCAATCAATAAATCAGTCACTATTTCATTTACTGTTAAGTTGA
TTCATTGAGTAGGATTTTACGTTAAAAACCTGAATACTTTCTGAAATCTT
GTTCTTAAAGAAGTGTTTAAGTTTTATGTCTCTGTTGTAGGAGACACGCT
GGCCGAGTTCGTGAAAGTAAACAAAAAGCTGAGCGAGGAGATCGCCTTGG
AATGTCTGGAACAAATCCTGGAAGGGCTGGTGTACCTGCATAAAAGGCGC
ATCATCCACGGAGACATCAAAGGTAGGTCAAAGTGCACAGTACAACGCTT
GCCATCATGCTGTCGATTGTACACTCCCTCAGTTAGTGTGCATCCATTGT
GATGATATATTCAGCTGTCAGACTCGACAGCATAAGGCCAAGGGAAAAAC
GTTGTGTTTTCTGTGACCCGACTTAGCATTGCAAAAATTTGCCGGCCCTA
GTCTTCTTGGAAGGTCGACCGATGACAAGGGACATGAAATGTTCGATCTG
ATACTTCAGTGACGAAAACGTTGTAGAATCGTTTGCAACATGTTCTCCTC
ATGTCTTTTACAATAGAAAATTGTACTTATGAAAACAGTATACCTGTATG
ATTAATGAAATATGATGTTGAAAATGCCAGTTTCCTGGTTTATCTCAGTT
TAACATTGTTTAACAGAATTTGTTGAATCACTTCGGCCAAAATCTAAAAA
GAGAGAAGAATCTTTCTTTCTCTCAGGACCTTAATCGGAAACACAACAAG
GATTTTTCCTAGGCCTAAGATCTTTCCCTTGCTTCCAGGGGACAACATTG
TTGTCACAGAAAAGGGAGAGGCGATAGTCTTGATTGACTTCGGCCTAGCC
CGTCAGCTCCCCCACAACGTGTCTGCTGTCCCCAGGGGGGAGCCAGCGAC
GGGGACCTACGCTTACCAAAGCCCCGAGGTCCGCTTCAGGCTCGGCCATG
ACTGTAAGGCCGATGTGTGGAGCGCCGTGTGTGTCTTATACTTCATGTTA
GAGGGCGCGACGCCCTCGTTCGACTTCAGTGAGTGCAAGGTAAGACACAC
AACAGTTTATAAAAACCGTTGATTCATTTACTTTCGCTGTAGTTATCTCT
ATGAAAATAAACACTTTTTCATGGGGATATTGTTTTGAGTGTGTTTGCGT
GTGTGTTTGCGTGCATGTATTTGTGTGTCTCCGGATACTTAAAGTTGAAA
TATGTTGTAACTGAGATAAGGGACATTGATAGATAAAAGTTGTGCAAATG
AAGACCTTATTTGCACAATTGATGAGAAAATACTGTAATTCCATATTGGT
AGATGACTGGAATGTCATACTTGTGGCACTTGGAAGTCTTGTGACAGTGA
ACATATATTATGCAAATGTAGGCCTAATTTGCGTAATATATATTTCATGG
AGATTTGAGGTTTCCGAAGTCTTGTTTTACTTTGTGGTAGGATGGGAAAA
GAGGGTTTCGCTGTGTCTTGAATTCGCGGTGGAAACAATTCTGTCGTAGA
GTAGTCCTACAAGGGAGGCATATTCGCGTAGACAGGATATTGCAAAATAC
GCGAAAATAAAAATCCGTTTAAGTACTGATTTGGTGAGTTCTATGACATG
CTTCGGAAGAATTAAAGATTATAGCGCATTTTTGTCGTTTTATCTAGATT
TTGCTGCTCTACAGTTCTCAGGTTTTTGTACCAACATGCAGAATCGTTTA
ATTTGCTGTTCTTTGCGTTATTGTTTTCGATTCGTGATTTCAATATTGAT
TTGTGTTTACTGACGTTTCTGTTGCAGTATTACTGTCCCAGGTTCCCCTG
TCCACACTCTGGCAGTCATCCATTCTCAAAAGCTGATCTTCCAGATTCGT
ACAGCGAAAAACTCAAGGATATTTTCTTCCGAGGTTTACACTATGATCCT
GGGCTCAGGGCGTCTGCAGAACAACTACAAAGTTAGTTCCATTTTAATCT
GTTAACTTGTTCTGAATGTGGTCTCAAGAATGTATATATTTATTTCTATT
TCTTTGTGATTATCTTGGTAGTGCTTCGGTCACAATTGGAAAAAAAGGGG
GCCCCATTGGGTAATTTACGGGCTATTTGTTTTGTACTTTCGGGCGTGAC
CCCTGTGTGCCCCCGTGGGACACCCTGCGGCTACCGGGCTATTATTGTGT
ACGACCGGGCCCCGGGTTGATTTTAATTTCGGAGATGAAAATAACACGGA
ACCCGGTAACAAATAGACGCCGTAAGCTGATCGTGAGAACACCGAGAGGT
ACCCCCACGAACAATACAAGAAAAACATATTTCGACATCAATTCTAATCA
ATCGCGCGATATCCATAATTTTAGTCGCAGGTTTCCTTTTTCGACATTCT
AGTGTAACTTTCGGTAGTCGCAAGGATTAATTCAACATGAATTTGCCAAC
GACTTTGATTCTTGTTTTCTTTATGATAAAGAAAACATTATTAAAATCAC
TTAAACAGTCTTTTGCCGCCTAACGTAGTAGCCTAAAAATAAGATACAGC
TTTTTTCCTTCTCTTTCAGGTATCTTAGGACAGTAGGAGCGAGCAAGGAG
CTGGCAATGTTAAGATGGGGCAACGGACAGTAAGCTGGACCCAACAAATG
CTAATAGGACTATTAATATGATGCAAAATACTAGTATTCAGTTCTTTCTT
CCCACTACTTAAGACAAATTTTCTTTTTCTTCTTGACACTGGGTACTTTA
TTCCGCAAAAACTTAGATAAAGGTGCAAATAAAAAACCCAAGACAACTAA
GCGAGTCTTAGGCGAGTTGACACAAACCAAAAGTAGACGGATAGATAGTC
TATTGACTTAAGCTAAATCAAATCATAAAGCTAAATTGATTTTTTAGCAA
GGGAAGAATATAATAGATATTGATGATTTAGGGACAAGACCTTAAAACAA
ACTGTACCGCTGTGGTTACAGAAAGTAGAATGCTGATGAATCAGCAAAAG
AACATGCGAAGAATAATTGCTACAATTTAATAGAAATTCATGTACAGTCC
TAGTTAAAATATCTGCTTAATTTTTGAAATGTAAAATTGAAGCAATTAAG
ACAACGGGGGTATCTGTTCCCATGTACATGAGTGTAATATAGCTAGATCA
ATTTTATAGATTCACAGCTTTATGAAGCACAATTATAGATTCATACTTAA
AACATTTTTAAAACAAGAAATTAAAAGAAATACATTTTGAATGTATTTTT
GATGAACCGATGTTTCATTCCAAATAATAGAAAGTGTCTAAAATTGATGT
ATCTTATATCATAATGTCAAGGTAGATTTTGAGCCTTATAGTGTCTTCTC
TTGTTTTGGTTGTCATTTCTTTTAACAACTTGTCAGATAGAACACGTGAT
TCGGTGAGCAGCGGATCGAACGCCCAAGCTCAAATACCTCAGAAATTTCA
CAACACATACATGTAGAATGACCTAGACATTCTGTCACAATCAAAAATTG
TCAACACAGAACCAGACCTTTTTGGCAAGAGGAATTAAAGAGGCCAAACA
CATCAACGCTTTGCAATCCATCGACGGAGACGGGAGGCGCCATAAACTTT
TTGCAGCGTATGGTCCACTGCTAACCGAGTTACGTGTGTTGGACCTGCAT
AACATGACGTCACAGAAGCGGTGGATTGCTCATTTCTTGACAAAGACTGG
AGCTGATCAGTCGAAAAAGTCATATGTGTTGGAAATTTACAATTCAACTT
TGATTTAGATACTACTTATGTCAGGCACAGACATGTGTCATTCTATCTAT
CTTCTAGATGTTTTCAAGTAAAACAAAGTTTTCTACTCTATAAGAGTAAG
CCAACCCCCTACTCTATAAGAGTAACCCCAAACTGGACCCGCGACGCGTT
GGCGACCTCGCTGCGTCCTAGATTGAATTTGAGTTAGCCTTGACTTTACA
ATGGGAATACCATGCAAAACGTACAAGTATGACTAAAAAGACAACAAATC
ACACAAAGCGTAAAAAGATTCGTTTTTCTACCGATGAAATTCGTTTAGCG
CGGTGTCAAATCACTCGGTCGCAGCGAGGTCGCCAGCGAGTCGCGGGTCC
AGTGAGAGACTTTTTTACAACAGTAAAAAGATCCACTAGGTGGACACCTC
AAGAGGAAAATATTGGCCCTGTTTAAGATGGAGAGACAACCTAGTTAAAC
ACCTGGGGCCCAATGGCCAAGAACTGGGAGACTAAGAAAAGACTGGCATG
GAGTCAGTGAAGGGAGAGGTTCCTCCTTTATGCTACGGTCCCATTTCCAA
CGCGGGGACCGGCCGGGCAGCCTGTGGGAACGAAAGATATGATATAAAAG
ACAACAAAAGACATGTTAAAAAATTACTTCTAACCATATATTGTGTATTT
TCCCGAAATACATTTTTTTCGTTTTCGCATACAGCCCGGCCGGGCCCCGG
AATGGAAATGGGACCGTAGCACGCTCCTTCACAGCGTCGTAATAAATTGA
CTTGTTCCACTGAATATGCGAGTGCGAGTCTTTTATGCAATTCACTTTTT
GGCCGCATGAGGGCTACTATAGCGGTTTGTTCGCAAAGACAGCCCTGGGA
CAGAGAGCGTATTTTTGGTGCGCGAAGCATGCTGGGAGGACGGTAGTATC
CTGGGGACGTGAATGTATGTGTGGATGTGCGGAGAAGGCCAAACTCGCTA
CCGTAGCAAACTCCCTTCCGTGACATAACTCCCCTCTCGGCAATCTAGAA
GGGTAATCTAACACCCTCGCAGCGCCACCAAATTAGGTACATTTTAAAGT
TCCCTTTGATATAACGTATCACCATTGTGGCAACATTTTACCCCCGAAAT
AGTAAACTTTCGTCTTGTTTTCGCCTCGGTAACTGTAGAAAATACTAGCT
AACTAGTGTACAGTCACACGTTGTATAGAGACGCACACAAGAGTCACACA
ACTTACGATTTGCTAAGGTAATTGAGACAAACACAAAACAAAACAAAATG
ACAGCCGTGGATTCCATATAGTTTTATTTTGTGTATTGGTTGAGCCCACG
ATCTAAACCTATGGCTTCTTCGCGGCGCTGGGTACGAGNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGGCCAAACTCGCTACCGTAGCA
AACTCCCTTCCGTGACATAACTCCCCTCTCGGCAATCTAGAAGGGTAATC
TAACACCCTCGCAGCGCCACCAAATTAGGTACATTTTAAAGTTCCCTTTG
ATATAACGTATCACCATTGTGGCAACATTTTACCCCCGAAATAGTAAACT
TTCGTCTTGTTTTCGCCTCGGTAACTGTAGAAAATACTAGCTAACTAGTG
TACAGTCACACGTTGTATAGAGACGCACACAAGAGTCACACAACTTACGA
TTTGCTAAGGTAATTGAGACAAACACAAAACAAAACAAAATGACAGCCGT
GGATTCCATATAGTTTTATTTTGTGTATTGGTTGAGCCCACGATCTAAAC
CTATGGCTTCTTCGCGGCGCTGGGTACGAGCGTGGGACCGTAGCATTAAT
AGGAATGATAACACCATGGAATAATGATTAAAAAAAAGAGCTATACCATA
CTGCAATGTACTGTCTGTGTGTGTGATCTTATTTCTTTACAGTAAGTACA
TCATGAGGAAGTGTACGTTTACAATCACCATTGGACCGATATAGCAATAT
ATATATACTGCCATGTGCCCATGTATATTACTTGGCTCACGTTTTGCTCC
AAAGCATCCAACCCAACACCATCCGATGTTTCCTTCCATTGGACTTTTAA
GTGCCAATGTCTGTAAGGATCAAACAATAGTGCTCACGGTCAGAAAATCG
ATTTGGCTCATATTTTGCACAGAGATAGTACTTGGCCCACAACCCCTGAA
AAAAGCTTTCTTTCCGCTCAACACCCATCGTTGCCATGGCAACAGCCCAA
TCAAGTTTCGGGGCCATTTGGCAGATTTTTGTATGGCGAGAACATGGAAA
TTGGCAAAGCTTAGGGCGCGCTCACTGCCAGATGCTTTAACGCAGTGCAA
AACTCAAAAGGATATTCTAAGACCAATGCCTAAACTTTCAGACATTGGCT
CTTAAGAGCTACAATCAACAGTAACACATTGCTGATCAGTCCTAGTGTAT
CAGCGTTTTTTTAAGAGAGTCTACACAGAGTTCATCTACGCACAGAGGTG
GAAAACGCAGTCTGGCTTTGGTTGAGTCTTGGGGTTGCCTGTGTAGATTT
CTAACTCTCCAGCTTCAAGGTCGAAAACGGCTGGAAAGGAAAAGAAGAAG
ATTAAAAAAAGACATTAAAAAACAGACGTTCTCCTGCAGGACCAAAGAAG
GCCGCTAGTATTCATCGGGACATTACATCACAGAGACCATTCGTATGTGA
GAGTCCTTTCTATGACGTCACGACAAATAGCTCATTTGTCCTACCAAAGA
GCACAGAGTGGACAAACAAAATTCCTACGTGAATGATAGAGGAACTTTCA
TTTAACAGGCATTTTAACAACTTGCCCTTGACTATAATTAATAATTGGAT
GGCTTAGACAGGACTGTCTCAAAACTTGTATTGAAAGCGAATAGGGAATT
CGAAAGGGTGTTTTTTAAGACCACTGCCAAACATTATGATGGAAGAACAC
TGAGGACGGCTTTTTTTTCCTTGCTACTATGATAAGTGTTGAGTGTAAAA
TGGTTACCTGTTGTTGCTGTTATGACTAGATCTTTCATTGTTCCAGTCCG
ATAGACCGGGTAGTCTGGGTCTTTTGTGTCACCTGAAAGAAAGAGACTCT
TGTTGTTAGACACTGTGTCAACTTGCAAAGAGTTATGTCTGATCGTGGAC
ATGGGACGCTCTATGTTCCGATGTCCCGACACCCCTTTGTTCCGACAACC
ATATGTTTCTACAGCCCTATGTTCCGACAACCCGATGTCCCGACACCCCT
GTGTTCCGATAACCATGCTTCTACAGCCCTATATGTTCCGACAGCCCTAT
GTTCCGACAACAACCATATGTTCCGACATCCCTGTGCATGACACCCCTAT
GTTCTGACACGATGCCCGTGTTCCGACACCACTATGTTCCAACATCCCTA
TATTCCGACAGCCCTATGCTGCAACGCCCCTGTGTTCTAACACCCCTATG
TCCCGATACCCGGCCTATGGTCCGACGCCTGTGTTCCGACATCTCTATGT
TCTGACATTCCTACGTTCCGACACCCCTATGTTAACTCACTCCTTTGTTC
CGACACCCCTACGTTCCCTCACTCCTATGTTCCGACACCCCTATGCTCTA
ACAGTGACACCCTTATGTTCAGAGATACCCCTATGTTCAGAGAACCCTGT
GCTTGAAATATAGATTTATATTTAAGTTACTGGAAAGGATAAAACAGAAT
CTTATACACACCAAGAAAGTTGAGCACGTCTTGCACTGTCTTAGCCGCCT
CCATTTCATCAGCACGTGCCTTCCTGTGTTGGGAACTAGGAGTTCGCCAC
TGTGGTATGTCCAGGTGGTCATACCTGTATAGTAAATAGCGGGCGTATAA
TCACTTATAATTAGTTATGTCACATCAATCTATCTTCGGAATGCCCCTAT
GGCTCAACTGGTAGAAGCCTCACAGATGAGCTTCTGGTTCCAATTAGTTA
CCAACTGGGAGATCTAGACCCGGGCTCGATCCTGGGTTGGGGACATCTCG
GTTGGGGCTGTAACCGTCTTTCAGAAGGGACGTAAAATGGGGGTCACCCC
GTGTTTGAGGAGGTGCCTCGAGCACATTAAAGGGGAAGGGCTAGTAACCC
CACCCAAATAAAATATGCCTTGCAATTGAAGCTGCAAGGATCTAAACTTG
CCACCATGTGCCATTAGACAAGAGTCTGAAGGAACGTTCAATTGAGGCAC
TTATTCATGCCAAAACCAGGTGCAACAACATAAACCATGATTTAAATGAA
ATGAACGAACTAAAGATCAATCTAACTCGTTTGGCTCCCAGATTTGAAAC
GTAGAACCCGGTCGGAAACACAAAAAAATCACTATAAAACAGGGTTTGGG
GGAAAATTCTTTACCTTTGTACGCACAGTTCCTGAGGGAGTGAATATAGT
TCGATTCACGTTTTCCTACCAGCCTTCTGTTTTTTGTGCTATCTTAAGTA
TCATTCATTTAATCCTATGTTCGTACTTTTTGTAAGTCAGTCTAGCTTGA
CTGAAGGTACTACCCAAATGTCTATAACATCAACAAATAGATATTAAATA
AAGCAAGTTTAGATATTTTCAGTGACCAGCCACTTACATGTTGTAGTGAT
AGTAATGGCCGACAGAACCCTTCTCTGCTTGTTCTATCCCTCGTACAGAG
ACCAGAGTGCCAGATGACTCCCCTTCGGTCGGCGCACACTCTATAGAGTA
CATCCTCCCCCTGTCGCCATGGAGAGTTGCTAGGTTACTACAGAACCCCA
AGGCCACGCCCACAGGAGTATTCCTGAGGATGTCTACAGCATGTTCCACA
GAGGAGGCCGTTAGGAGGGCGCGGTTCATGAAGTGACGAACTGCAAGAAA
AAAGGGATACAAATGTCAGCGAAAAGGAAAGTAAAAGGAAAATGACCTCG
ATCTGAAACTATGAAATAAATCTGT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000280:240371..255245+ >Blg00037.5 ID=Blg00037.5|Name=Blg00037.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=891bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000280:240371..255245+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATCTTACTGCCTTTCCCTTGTCCTGCTGTTGAACAGGTTCCCCCACC
AGGGTACAGGGCTGAGGAAATCGAGATTTGGGGTGAATTGGTCCACCCAA
AGATCAACAGAATGTACGGCATCCTGAGGGAGAGAAACTTCTACTACTTC
ATGGAGTACATATATGGAGACACGCTGGCCGAGTTCGTGAAAGTAAACAA
AAAGCTGAGCGAGGAGATCGCCTTGGAATGTCTGGAACAAATCCTGGAAG
GGCTGGTGTACCTGCATAAAAGGCGCATCATCCACGGAGACATCAAAGGG
GACAACATTGTTGTCACAGAAAAGGGAGAGGCGATAGTCTTGATTGACTT
CGGCCTAGCCCGTCAGCTCCCCCACAACGTGTCTGCTGTCCCCAGGGGGG
AGCCAGCGACGGGGACCTACGCTTACCAAAGCCCCGAGGTCCGCTTCAGG
CTCGGCCATGACTGTAAGGCCGATGTGTGGAGCGCCGTGTGTGTCTTATA
CTTCATGTTAGAGGGCGCGACGCCCTCGTTCGACTTCAGTGAGTGCAAGT
ATTACTGTCCCAGGTTCCCCTGTCCACACTCTGGCAGTCATCCATTCTCA
AAAGCTGATCTTCCAGATTCGTACAGCGAAAAACTCAAGGATATTTTCTT
CCGAGGTTTACACTATGATCCTGGGCTCAGGGCGTCTGCAGAACAACTAC
AAAAGACCAGAGTGCCAGATGACTCCCCTTCGGTCGGCGCACACTCTATA
GAGTACATCCTCCCCCTGTCGCCATGGAGAGTTGCTAGGTTACTACAGAA
CCCCAAGGCCACGCCCACAGGAGTATTCCTGAGGATGTCTACAGCATGTT
CCACAGAGGAGGCCGTTAGGAGGGCGCGGTTCATGAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:240371..240536 | Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:240371..240536 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:240761..240892 | Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:240761..240892 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:241409..241659 | Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:241409..241659 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:242398..242551 | Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:242398..242551 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:254969..255245 | Blg00037.5-exon-Sc0000280-1570713199:254969..255245 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000280 | genome | Sc0000280:240371..255245 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg00037 |
|
